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NVIDIA Clara Parabricks

Analisi avanzata delle sequenze di genoma

Dall'DNA all'RNA, NVIDIA Clara^™ Parabricks offre una potente accelerazione per analisi di dati genomici di tipo primario, secondario e terziario, grazie a un software pronto all'uso progettato per laboratori ad alta produttività e utilizzabile in sede o su cloud. Lo stack tecnologico su cui si basata garantisce agli sviluppatori la possibilità di creare potenti strumenti di calcolo per la genomica.

Accelerare l'analisi del genoma

Per laboratori ad alta produttività
Per sviluppatori

Clara Parabricks Pipelines

Basato sul toolkit per l'analisi del genoma del Broad Institute (GATK), NVIDIA Clara Parabricks Pipelines è una suite software pronta all'uso accelerata da GPU per le mutazioni germinali del DNA nello studio genomico della popolazione, le mutazioni somatiche del DNA nello studio genomico dei tumori e i progetti di sequenziamento di RNA dall'intero trascrittoma all'analisi della singola cella.

Ottimizzata per velocità, precisione e scalabilità, la suite Clara Parabricks Pipelines supporta le best practice di GATK4.1 ed è completamente configurabile, consentendo agli utenti di scegliere i passaggi, le impostazioni di parametri e le versioni della pipeline da eseguire.

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Produttività e prestazioni senza precedenti per l'analisi di tipo secondario

Eseguita su GPU NVIDIA A100 Tensor Core, la suite Clara Parabricks Pipelines offre prestazioni senza precedenti riducendo i tempi di analisi delle mutazioni germinali del DNA di 20 minuti. Con l'accelerazione della GPU, gli utenti possono inoltre beneficiare della riduzione dei costi del cloud computing fino al 50% rispetto alle soluzioni con sola CPU.

Confronto tra prestazioni con GPU e sola CPU

Prestazioni di analisi secondaria completa delle linee germinali

Perché usare Clara Parabricks Pipelines

Inizio semplificato

Clara Parabricks Pipelines può essere configurato in 10 minuti. Usa questa video guida dettagliata per iniziare subito a eseguire analisi ad alta produttività per progetti di sequenziamento di DNA ed RNA.

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Diagnosi veloce. Risultati migliori con trattamenti migliori.

Clara Parabricks Pipelines restituisce più rapidamente i risultati rispetto alle soluzioni non accelerate da GPU. Scopri come TGEN utilizza le analisi che generano risultati nello stesso giorno per studiare l'intera sequenza del genoma di cellule sane e cellule malate e stabilire la terapia più efficace e personalizzata per ciascun paziente.

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Dati genomici più affidabili

Eseguita nel cloud o in locale, Clara Parabricks Pipelines aiuta i ricercatori a comprendere meglio e più velocemente le pandemie virali come il COVID-19, dall'evoluzione del virus alla risposta dell'uomo, fino alla suscettibilità delle popolazioni. Guarda per scoprire come.

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Strutture che usano Clara Parabricks Pipelines

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Clara Parabricks Toolkit

Una raccolta di librerie accelerate da GPU, applicazioni di riferimento e applicazioni open-source, NVIDIA Clara Parabricks Toolkit è stato creato per gli sviluppatori e consente di creare flussi di lavoro assistiti da IA per l'analisi del genoma. Con il toolkit, è possibile ottimizzare mappature, allineamento e pulizia di nuove sequenze di genoma e migliorare la risoluzione dell'epigenomica delle singole cellule.

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Novità

Nuove funzionalità. Velocità accelerata.

Con l'ultima versione di NVIDIA Clara Parabricks Pipelines 3.0, gli utenti possono beneficiare di un aumento delle prestazioni del 30%, accedere a nuovi flussi di analisi dell'RNA e avviare la suite software nel cloud sulla piattaforma DNAnexus.

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Il supercomputer Artemis nello studio genomico della popolazione e nella lotta al COVID-19

Basato su NVIDIA DGX^™ e NVIDIA Clara Parabricks, il supercomputer Artemis viene utilizzato per studiare i genomi dei cittadini di Abu Dhabi e migliorare la sanità nell'intero paese.

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