NVIDIA Clara Parabricks

Analisi avanzata delle sequenze di genoma

Dall'DNA all'RNA, NVIDIA Clara Parabricks offre una potente accelerazione per analisi di dati genomici di tipo primario, secondario e terziario, grazie a un software pronto all'uso progettato per laboratori ad alta produttività e utilizzabile in sede o su cloud. Lo stack tecnologico su cui si basata garantisce agli sviluppatori la possibilità di creare potenti strumenti di calcolo per la genomica.

Accelerare l'analisi del genoma

  • Per laboratori ad alta produttività
  • Per sviluppatori
Clara Parabricks Pipelines

Clara Parabricks Pipelines

Basato sul toolkit per l'analisi del genoma del Broad Institute (GATK), NVIDIA Clara Parabricks Pipelines è una suite software pronta all'uso accelerata da GPU per le mutazioni germinali del DNA nello studio genomico della popolazione, le mutazioni somatiche del DNA nello studio genomico dei tumori e i progetti di sequenziamento di RNA dall'intero trascrittoma all'analisi della singola cella.

Ottimizzata per velocità, precisione e scalabilità, la suite Clara Parabricks Pipelines supporta le best practice di GATK4.1 ed è completamente configurabile, consentendo agli utenti di scegliere i passaggi, le impostazioni di parametri e le versioni della pipeline da eseguire.

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Produttività e prestazioni senza precedenti per l'analisi di tipo secondario

Eseguita su GPU NVIDIA A100 Tensor Core, la suite Clara Parabricks Pipelines offre prestazioni senza precedenti riducendo i tempi di analisi delle mutazioni germinali del DNA di 20 minuti. Con l'accelerazione della GPU, gli utenti possono inoltre beneficiare della riduzione dei costi del cloud computing fino al 50% rispetto alle soluzioni con sola CPU.

Confronto tra prestazioni con GPU e sola CPU

Perché usare Clara Parabricks Pipelines

Inizio semplificato

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Clara Parabricks Pipelines può essere configurato in 10 minuti. Usa questa video guida dettagliata per iniziare subito a eseguire analisi ad alta produttività per progetti di sequenziamento di DNA ed RNA.

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Diagnosi veloce. Risultati migliori con trattamenti migliori.

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Clara Parabricks Pipelines restituisce più rapidamente i risultati rispetto alle soluzioni non accelerate da GPU. Scopri come TGEN utilizza le analisi che generano risultati nello stesso giorno per studiare l'intera sequenza del genoma di cellule sane e cellule malate e stabilire la terapia più efficace e personalizzata per ciascun paziente.

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Dati genomici più affidabili

Eseguita nel cloud o in locale, Clara Parabricks Pipelines aiuta i ricercatori a comprendere meglio e più velocemente le pandemie virali come il COVID-19, dall'evoluzione del virus alla risposta dell'uomo, fino alla suscettibilità delle popolazioni. Guarda per scoprire come.

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Strutture che usano Clara Parabricks Pipelines

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Clara Parabricks Toolkit

Clara Parabricks Toolkit

Una raccolta di librerie accelerate da GPU, applicazioni di riferimento e applicazioni open-source, NVIDIA Clara Parabricks Toolkit è stato creato per gli sviluppatori e consente di creare flussi di lavoro assistiti da IA per l'analisi del genoma. Con il toolkit, è possibile ottimizzare mappature, allineamento e pulizia di nuove sequenze di genoma e migliorare la risoluzione dell'epigenomica delle singole cellule.

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Novità

Nuove funzionalità. Velocità accelerata.

Con l'ultima versione di NVIDIA Clara Parabricks Pipelines 3.0, gli utenti possono beneficiare di un aumento delle prestazioni del 30%, accedere a nuovi flussi di analisi dell'RNA e avviare la suite software nel cloud sulla piattaforma DNAnexus.

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Il supercomputer Artemis nello studio genomico della popolazione e nella lotta al COVID-19

Basato su NVIDIA DGX e NVIDIA Clara Parabricks, il supercomputer Artemis viene utilizzato per studiare i genomi dei cittadini di Abu Dhabi e migliorare la sanità nell'intero paese.

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