NVIDIA Clara Parabricks

Комплексный анализ секвенирования генома

Платформа NVIDIA Clara Parabricks обеспечивает значительное ускорение первичного, вторичного и третичного анализа геномных данных. Это достигается благодаря использованию готового ПО для лабораторий с высокой пропускной способностью на локальных системах или в облаке и стеку технологий, которые позволяют разработчикам создавать мощные вычислительные инструменты для геномики.

Ускорение анализа генома

  • Для лабораторий с высокой пропускной способностью
  • Разработчикам
Clara Parabricks Pipelines

Clara Parabricks Pipelines

Clara Parabricks Pipelines — это набор готового GPU-ускоренного ПО, который основан на инструментах Genome Analysis Toolkit от Broad Institute и предназначен для определения вариантов ДНК зародышевой линии для задач популяционной геномики, определения вариантов ДНК в соматических клетках для онкогеномики, а также для секвенирования РНК: от полного транскриптома до анализа отдельных клеток.

ПО Clara Parabricks Pipelines оптимизирует скорость, точность и масштабируемость, поддерживает рекомендации GATK4.1 Best Practices и имеет гибкую конфигурацию, что позволяет пользователям выбрать шаги, настройки и версии конвейера для запуска.

Читать краткий обзор решения ›

Получить бесплатную пробную версию на один месяц ›

Посмотреть цены ›

Непревзойденная производительность и пропускная способность вторичного анализа

Clara Parabricks Pipelines работает на базе GPU NVIDIA A100 с тензорными ядрами и обеспечивает максимальную производительность, сокращая время определения вариантов ДНК зародышевой линии до 20 минут. Благодаря ускорению GPU пользователи также получают снижение затрат на облачные вычисления до 50% по сравнению с решениями только на базе CPU.

Сравнение производительности на GPU и на CPU

Почему стоит выбрать Clara Parabricks Pipelines

Простое начало работы

Простое начало работы

Clara Parabricks Pipelines можно настроить за 10 минут. Следуйте пошаговым инструкциям в этом видео и начните использовать ускорение для проектов по секвенированию ДНК и РНК.

Смотреть видео ›

Смотреть документацию >

Ускорение диагностики. Улучшение результатов лечения.

Ускорение диагностики. Улучшение результатов лечения.

Clara Parabricks Pipelines выдает результаты быстрее, чем аналогичные решения без ускорения на GPU. Узнайте, как институт TGEN получает результаты за один день и исследует полную последовательность генома больных и здоровых клеток, чтобы определить наиболее эффективное лечение, индивидуально подобранное для каждого пациента.

Читать пример из практики ›

Больше информации о геноме

Clara Parabricks Pipelines в облаке или на локальной системе помогает ученым быстрее понять природу вирусных пандемий, таких как COVID-19: от эволюции вируса до реакции и восприимчивости людей. Узнайте, как это работает.

Смотреть вебинар ›

Пользователи Clara Parabricks Pipelines

tohoku-medical-megabank-organization-logo
population-genome-program-logo
thailand-population-genome-program-logo
personalis-logo
tgen-logo
institute-of-medical-science-university-of-tokyo-logo
national-taiwan-university-hospital-logo

БЕСПЛАТНАЯ ПРОБНАЯ ВЕРСИЯ НА ОДИН МЕСЯЦ

Clara Parabricks Toolkit

Clara Parabricks Toolkit

NVIDIA Clara Parabricks Toolkit — это набор GPU-ускоренных библиотек, референсных приложений и приложений с открытым кодом, который помогает разработчикам использовать ИИ в рабочих процессах для геномного анализа. Используя набор инструментов, они могут оптимизировать картирование, выравнивание и полировку сборки генома de novo, а также повысить разрешение эпигеномики одной клетки.

Подробнее

Новости

Новые функции. Высокие скорости.

Благодаря новой версии NVIDIA Clara Parabricks Pipelines 3.0 исследователи могут повысить производительность на 30%, получить доступ к новому конвейеру анализа РНК и запускать набор ПО на облачной платформе DNAnexus.

Подробнее ›

Суперкомпьютер Artemis для исследований популяционной геномики и COVID-19

Созданный на базе NVIDIA DGX и NVIDIA Clara Parabricks суперкомпьютер Artemis призван повысить уровень знаний о геномах граждан Абу-Даби и улучшить систему здравоохранения в стране.

Читать блог ›

Получайте новостную рассылку по решениям для медицины NVIDIA