NVIDIA Clara Parabricks

Комплексное секвенирование генома

Высокопроизводительный и высокоточный геномный анализ с NVIDIA Clara™ Parabricks. Clara Parabricks — это фреймворк для геномики с ускорением на GPU. Платформа обеспечивает быстрое и высокоточное секвенирование нового поколения, которое необходимо для работы исследователей, аналитических групп, врачей и сотрудников лабораторий и ресурсных центров.

Высокая пропускная способность

Высокая пропускная способность

Обработка до 60 полных геномов в день на одном сервере.

Повышенная точность

Повышенная точность

Быстрое секвенирование без потери точности. Доступен набор для определения вариантов ДНК зародышевой линии и в соматических клетках.

Гибкость исполнения

Гибкость исполнения

Более 33 инструментов для удовлетворения различных нужд приложений и конвейеров.

Ускорение в 30–60 раз

Ускорение в 30–60 раз

Снижение затрат на вычисления до 50% и ускорение работы в 30–60 раз по сравнению с решениями только на базе CPU.

Ускоренные приложения для геномного анализа

NVIDIA ускоряет анализ вариантов ДНК зародышевой линии, соматических клеток и структуры генома, а также повышает производительность секвенатора и точность распознавания азотистых оснований на всех стадиях: от файлов FASTQ до BAM и VCF.

От FASTQ до VCF

Секвенирование нового поколения на локальных и облачных системах

Для запуска NVIDIA Clara Parabricks требуется как минимум два графических процессора. Локальная лицензия — это годовая подписка для одного графического процессора, которая включает в себя полный доступ ко всем конвейерам NVIDIA Clara Parabricks.

NVIDIA DGX A100

Локальные решения

Clara Parabricks на базе системы  NVIDIA DGX™ A100 анализирует до 25 000 полных геномов в год (30-кратное секвенирование) с помощью пакета Genome Analysis Toolkit (GATK), разработанного в Broad Institute. Пропускная способность линейно увеличивается с количеством DGX A100.

В облаке

Время — деньги. Когда мы говорим об облачных технологиях, это утверждение верно на 100 процентов. Выбирайте подходящие инстансы GPU, способные анализировать геномы за считанные минуты. Для ускорения развертывания на платформе AWS доступен фреймворк Clara Parabricks в качестве виртуального устройства Amazon Machine Image (AMI).

AWS Marketplace: NVIDIA Clara Parabricks

Clara Parabicks для реальных задач

DeepVariant с Clara Parabricks

Regeneron Genetics Center

Узнайте, как компания Regeneron использует DeepVariant с Clara Parabricks для создания масштабируемых высококачественных данных, которые могут быть воспроизведены другими специалистами в области геномики.

NVIDIA DGX A100 и Clara Parabricks

Национальный биобанк Таиланда (NBT)

Национальный биобанк Таиланда смог сократить время обработки данных секвенирования всего генома на 4 месяца и время обработки для отдельного пользователя с 30 до 1-2 часов благодаря NVIDIA DGX A100 и Clara Parabricks.

GPU NVIDIA V100 с тензорными ядрами

Исследовательский институт трансляционной геномики (TGen)

С помощью графических процессоров NVIDIA V100 с тензорными ядрами и фреймворка NVIDIA Clara Parabricks специалисты TGen в 6 раз ускорили анализ данных геномного секвенирования для определения индивидуальных методов лечения детей с редкими неврологическими расстройствами.

NVIDIA Clara Parabricks

Университет Вашингтона в Сент-Луисе (WUSTL)

NVIDIA Clara Parabricks и интеграция GPU позволили профессору Тихеле Тернер (Tychele Turner) из Университета Вашингтона значительно сократить время выполнения для вызова вариантов de novo.

Материалы

  • Корпоративная поддержка
  • Документация

Служба технической поддержки Parabricks гарантирует простой и надежный способ повысить производительность и сократить время простоя систем. Поддержка NVIDIA для Parabricks включает в себя:

  • Прямую связь с техническими и отраслевыми экспертами NVIDIA
  • Помощь в установке и использовании Parabricks Pipelines
  • Оперативное решение вопросов (круглосуточная поддержка)
  • Доступ ко всем обновлениям ПО, исправлениям безопасности и ошибок
  • «Костыльные» решения для подтвержденных ошибок

Начать работу

У вас уже есть договор со службой поддержки?

Вход на портал технической поддержки >

Хотите продлить свой договор?

Свяжитесь с менеджером по продажам.

Возникли дополнительные вопросы?

Напишите на parabricks-support@nvidia.com

Начало работы

Установите пробную лицензию и настройте Clara Parabricks Pipelines всего за 10 минут! Ознакомьтесь с пошаговым руководством в этом коротком видео или узнайте подробнее о доступных инструментах в технической документации Parabricks.

Получите бесплатную 90-дневную пробную лицензию NVIDIA Clara Parabricks уже сегодня или свяжитесь с нашим отделом продаж для получения информации о расценках.