유전체학 분석을 위한 가속 컴퓨팅
바이오인포매틱스 워크플로우를 위한 신속하고 정확한 확장형 솔루션
NVIDIA Parabricks
유전체 분석 가속화
NVIDIA® Parabricks®는 검증된 오픈소스 도구들을 GPU로 가속한 버전을 제공하는, 확장 가능한 유전체학 2차 분석 소프트웨어 제품군입니다.
주요 시퀀싱 장비와 호환이 되므로 연구자, 생물정보학자, 데이터 사이언티스트는 다양한 바이오인포매틱스 워크플로우에서 Parabricks를 활용할 수 있습니다.
Parabricks는 런타임을 단축하여 속도를 높이고 비용을 절감하면서도 정확도를 향상하고 투명성을 보장합니다. 그 결과, 연구자들은 생물학적 인사이트를 더 빠르게 얻고 새로운 발견을 보다 신속하게 이끌어낼 수 있습니다.
NVIDIA AI Blueprint
유전체학 및 단세포 솔루션 손쉽게 배포하기
NVIDIA AI Blueprint는 유전체학과 단세포 분석을 위한 가볍고 쉽게 배포할 수 있는 Blueprint입니다.
생물정보학자와 유전체학 플랫폼 제공업체를 위해 구축된 AI Blueprint를 사용하면 GPU나 클라우드 프로비저닝 없이도 scverse가 개발한 RAPIDS-single-cell을 포함하여 NVIDIA Parabricks와 NVIDIA RAPIDS™를 손쉽게 배포하고 테스트할 수 있습니다.
덕분에 과학자와 연구자들은 가속화된 유전체학 라이브러리를 손쉽게 평가하고 접근성을 확장할 수 있으므로 더 빠르게 준비하고 시작하여 유전체에 대한 이해를 심화할 수 있습니다.
NVIDIA NIM 마이크로서비스
정렬 및 변이 검출 최적화하기
NVIDIA NIM™ 마이크로서비스는 최적화되고 구성 가능한 프로덕션 레디 마이크로서비스로, 정렬을 위한 FQ2BAM과 범용 변이 검출을 위한 DeepVariant를 갖추고 있습니다.
데이터 사이언티스트와 개발자는 클라우드 네이티브 애플리케이션의 간편한 생성과 배포를 지원하는 업계 표준 API를 통해 생성형 AI 분야의 최신 발전 사항에 액세스할 수 있습니다.
분석에 소요되는 시간을 단축하세요. 정렬의 경우, 프로덕션 수준 업계 표준 정렬은 몇 시간이 아닌 몇 분 안에 이루어집니다. 또한, 다양한 시퀀싱 플랫폼에서 변이 검출 성능을 최적화할 수 있습니다.
연계 기술
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플랫폼 업데이트
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FAQ
NVIDIA Parabricks는 2차 게놈 분석을 위한 GPU 가속 소프트웨어 제품군입니다. Parabricks는 모든 주요 시퀀싱 장비와 호환되며 다양한 생물 정보학 워크플로우를 지원합니다.
Parabricks는 2차 유전체학 분석의 속도를 높이고, 비용을 절감하며, 정확도를 향상시킵니다.
- 속도 향상: CPU 전용 솔루션에 비해 135배 빠른 전유전체 시퀀싱(WGS) 분석을 경험해 보세요.
- 비용 절감: WGS는 CPU 전용 솔루션에 비해 컴퓨팅 비용을 최대 50% 절감합니다.
- 정확도 향상: 모든 주요 시퀀서에 고정확도 딥 러닝을 배포합니다.
- 투명성 보장: 신뢰할 수 있는 오픈 소스 도구의 결과를 재현하세요.
Parabricks는 NVIDIA NGC™에서 공용 컨테이너로 온프레미스 또는 모든 클라우드 서비스 플랫폼 또는 제공업체에서 사용할 수 있습니다.
임상 워크플로우, 대규모 시퀀싱 프로젝트, 고 처리량 플랫폼 또는 즉각적인 지원이 필요한 기타 워크플로우에서 Parabricks에 대한 지원이 필요한 고객에게 NVIDIA는 NVIDIA AI Enterprise를 제공합니다.
Parabricks는 공용 클라우드 공급자, 플랫폼 및 파트너, 그리고 온프레미스에서 실행할 수 있습니다.
- 퍼블릭 클라우드 제공업체: AWS, Google Cloud, Oracle Cloud, Microsoft Azure, Naver Cloud Platform, Baidu AI Cloud, Alibaba Cloud
- 플랫폼 및 파트너: DNAnexus, Seqera, AWS HealthOmics, Terra, Velsera, FormBio, Lifebit
- 온프레미스: NVIDIA DGX™ 시스템, NVIDIA 인증 서버, Dell Technologies, Hewlett Packard Enterprise, Lenovo, Cisco, Atos, Supermicro
Parabricks는 오픈 소스 도구의 정확도와 일치하므로 오픈 소스 도구를 전환하고 Parabricks를 사용해 동일한 결과를 얻을 수 있습니다. 그러나 Parabricks는 이러한 도구를 가속화하여 분석을 더 빠르게 실행할 수 있습니다. 최신 속도 벤치마크는 아래 표에서 확인할 수 있습니다.
| NVIDIA RTX PROTM 6000 Newest Support | NVIDIA H100 SXM GPU | NVIDIA L4 GPU Lowest Cost Per Sample | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 2 GPUs | 4 GPUs | 2 GPUs | 4 GPUs | 2 GPUs | 4 GPUs | |
| Giraffe(Paired-End) | 59.37 | 31.05 | 60.10 | 37.68 | 81.43 | 44.57 |
| DeepSomatic | 43.28 | 23.93 | 54.32 | 35.13 | 215.33 | 110.05 |
| Fq2bam(BWA-MEM) | 9.02 | 6.52 | 10.10 | 7.28 | 35.10 | 19.28 |
| rna_fq2bam(STAR) | 7.55 | 7.03 | 7.78 | 10.23 | 22.28 | 12.73 |
| fq2bam_meth(BWA-Meth) | 32.27 | 22.13 | 34.60 | 20.35 | 132.43 | 67.03 |
| DeepVariant | 4.67 | 2.75 | 7.60 | 5.90 | 13.83 | 8.03 |
| HaplotypeCaller | 8.33 | 3.83 | 8.63 | 4.17 | 14.20 | 7.03 |
| Mutect2 | 29.50 | 13.52 | 27.67 | 13.67 | 50.91 | 26.63 |
최신 지원, 가장 빠른 속도, 최저 샘플당 비용을 위한 가장 인기 있는 NVIDIA GPU의 최신 벤치마크.
성능 시간은 분 단위로 표시됩니다.
Parabricks는 도커 이미지로 제공되며, 온프레미스 또는 NVIDIA GPU를 사용할 수 있는 모든 클라우드 환경에서 실행할 수 있습니다. Parabricks는 일반적인 오픈 소스 도구와 동등한 결과를 생성하므로 기존 워크플로우의 주요 부분을 가속화하는 드롭인 대체물로 사용할 수 있습니다. 또한 완전하게 구성 가능하여 사용자가 실행할 단계와 매개변수 설정을 선택할 수 있으며, NextFlow 및 Cromwell과 같은 주요 워크플로우 관리자와 호환됩니다.