Análisis Integral del Secuenciamiento Genómico
Del DNA al RNA, NVIDIA Clara™ Parabricks ofrece una potente aceleración para los análisis primarios, secundarios y terciarios de los datos genómicos. Esto es posible gracias al software listo para usarse que se diseñó para los laboratorios de alta productividad en las instalaciones o en cloud, y un conjunto de tecnología que les brinda a los desarrolladores la capacidad de desarrollar potentes herramientas de procesamiento para las tareas de genómica.
NVIDIA Clara Parabricks Pipelines es un conjunto software acelerado por GPU listo para usarse, que se basa en el Conjunto de Herramientas de Análisis Genómico (GATK) del Instituto Broad y está orientado a la identificación de variantes en la línea germinal del ADN para la genómica de poblaciones, la identificación de variantes en las células somáticas del ADN para la genómica del cáncer y los proyectos de secuenciamiento del ARN desde todo el transcriptoma hasta el análisis de una sola célula.
Clara Parabricks Pipelines se optimizó para la velocidad, la precisión y la escalabilidad, dado que puede ejecutar GATK4.1 Best Practices y es completamente configurable. De esta manera, los usuarios pueden elegir los pasos, las configuraciones de parámetros y las versiones del proceso que desean ejecutar.
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Clara Parabricks Pipelines se ejecuta en NVIDIA A100 Tensor Cores y ofrece un rendimiento incomparable para reducir el tiempo de análisis a 20minutos para la identificación de variantes en la línea germinal del ADN. Con la aceleración por GPU, los usuarios pueden aprovechar una reducción en los costos de procesamiento en cloud de hasta el 50%, en comparación con las soluciones que usan solo CPU.
Rendimiento de Soluciones con GPU y solo con CPU
Rendimiento del aálisis secundario integral de la línea germinal
Clara Parabricks Pipelines se puede configurar en 10 minutos. Usa este detallado video tutorial para comenzar a experimentar el análisis de alta productividad en proyectos de secuenciamiento de ADN y ARN.
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Clara Parabricks Pipelines ofrece resultados más rápidos, en comparación con las soluciones que no están aceleradas por GPU. Conoce la forma en que TGEN usa los resultados obtenidos en el mismo día para investigar toda la secuencia genómica de células saludables y enfermas con el objetivo de determinar la terapia más eficaz y personalizada para cada paciente.
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Clara Parabricks Pipelines se ejecuta en cloud o en las instalaciones para comprender mejor y más rápido las pandemias virales como COVID-19, desde la evolución del virus hasta la respuesta y la susceptibilidad de los humanos. Mira el video para obtener más información.
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NVIDIA Clara Parabricks Toolkit es una colección de aplicaciones de código abierto, aplicaciones de referencia y bibliotecas en el edge aceleradas por GPU. Se diseñó para que los desarrolladores creen workflows asistidos por IA para el análisis genómico. Gracias a este conjunto de herramientas, pueden optimizar el mapeo, la asignación y el ajuste de conjuntos de genomas de novo y mejorar la resolución de la epigenómica de células únicas.
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