Análisis Acelerado de Secuenciación del Genoma Completo

Experimenta la secuenciación de ADN y ARN de alto rendimiento y alta precisión con NVIDIA Clara Parabricks.

Prueba Gratuita por 90 Días

Potencia el análisis genómico más rápido y preciso con NVIDIA Clara™ Parabricks. Clara Parabricks, un framework de aplicaciones de genómica computacional acelerado por GPU, ofrece un análisis preciso y acelerado de datos de secuenciación de próxima generación para investigadores y equipos clínicos, así como centros médicos y de secuenciación para enfermedades genéticas y cáncer.

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Alto Rendimiento

Alto Rendimiento

Procesa hasta 60 genomas completos por día en un solo servidor.

Mejor Precisión

Mejor Precisión

No hay necesidad de sacrificar la precisión para reducir el tiempo de respuesta. Un conjunto de líneas germinales y células somáticas está disponible.

Proceso Flexibles

Proceso Flexibles

Crea procesos personalizados y acelerados configurando más de 33 herramientas para cualquier necesidad específica de proceso o aplicación.

30–60 Veces Más Rápido

30–60 Veces Más Rápido

Reduce los costos de computación hasta en un 50 por ciento con una ejecución entre 30 a 60 veces más rápida que las soluciones solo de CPU.

Aportar el Rendimiento Acelerado por GPU a la Biocomputación

Acelera los procesos integrales, desde FastQ hasta Variant Call Format (VCF), en tan solo 23 minutos para un genoma completo y tres minutos para un exoma completo.

Los datos se generaron utilizando datos disponibles públicamente para NA 12878 eliminando los datos a una cobertura de 30 veces. Para el tiempo de ejecución de 23 minutos, se utilizó una DGX A100 con memoria 320G. Los números nativos de GATK4.1 se generaron utilizando 32 vCPU [Intel Xeon® Platinum 8175M de 3.1 GHz] utilizando 128 Gb de RAM.

Moverse Más Rápido y Más Fácil

El rendimiento de REDCINE-X PRO mide los FPS geomedidos de video en 6K y 8K.

Aplicaciones Aceleradas para el Análisis Genómico

Desde FASTQ hasta Binary Alignment Map (BAM) y VCF, NVIDIA acelera el análisis genómico para workflows somáticos, de línea germinal y variantes estructurales, además de mejorar las velocidades del secuenciador y la precisión de las llamadas de base de lectura de consenso.

FASTQ a Binary Alignment Map (BAM) a VCF

Secuenciación de Próxima Generación en las Instalaciones o en el Cloud

La ejecución de NVIDIA Clara Parabricks requiere un mínimo de dos GPU. Las licencias locales son suscripciones anuales por GPU, que incluyen acceso completo a todos los procesos de la suite de software NVIDIA Clara Parabricks.

NVIDIA DGX A100

Soluciones en las Instalaciones

Clara Parabricks se ejecuta en una  NVIDIA DGX™ A100 y analiza hasta 25,000 genomas completos por año (cobertura de 30 veces) con Genomic Analysis Toolkit (GATK) de Broad Institute. El rendimiento se escala linealmente más allá de una sola DGX A100.

Más información sobre DGX A100

En el Cloud

En el cloud, el tiempo es dinero. Elige entre una gama de instancias de GPU capaces de analizar genomas en cuestión de minutos. Para facilitar la implementación en AWS, Clara Parabricks está disponible en una Imagen de Máquina de Amazon (AMI) para su uso inmediato.

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AWS Marketplace: Pipelines de NVIDIA Clara Parabricks

Cómo Clara Parabricks Tiene un Impacto en el Mundo Real

DeepVariant con Clara Parabricks

Centro de Genética Regeneron

Descubre cómo Regeneron está utilizando DeepVariant con Clara Parabricks para generar datos escalables y de alta calidad que se pueden reproducir en toda la comunidad genómica.

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NVIDIA DGX A100 y Clara Parabricks

Biobanco Nacional de Tailandia (NBT)

NBT redujo su procesamiento de datos de secuenciación del genoma completo en cuatro meses y su tiempo de procesamiento de usuario individual de más de 30 horas a solo 1-2 horas con NVIDIA DGX A100 y Clara Parabricks.

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GPU NVIDIA V100 con Tensor Core

Instituto de Investigación en Genómica Traslacional (TGen)

Con NVIDIA Clara Parabricks y las GPU NVIDIA V100 Tensor Core, TGen aceleró el análisis de secuenciación genómica en 6 veces para ayudar a determinar tratamientos personalizados para niños con trastornos neurológicos raros.

Leer la historia de éxito
NVIDIA Clara Parabricks

Universidad de Washington en Saint Louis (WUSTL)

La integración de pasos basados en GPU con NVIDIA Clara Parabricks permitió a Tychele Turner de WUSTL reducir enormemente el tiempo de ejecución para las llamadas de variantes de novo.

Ver el webinar

Recursos

  • Soporte para Empresas
  • Documentación

Los Servicios de Soporte de Pipelines de Parabricks te brinda asistencia de forma sencilla y confiable para mejorar la productividad y reducir el tiempo de inactividad de tus sistemas de análisis de producción. Los Servicios de Soporte de NVIDIA para Parabricks incluyen:

  • Comunicación directa con técnicos y expertos de NVIDIA
  • Ayuda con la instalación y el uso de Pipelines de Parabricks
  • Respuesta rápida y resolución oportuna de problemas (los casos se aceptan para el soporte remoto las 24 horas al día, 7 días a la semana)
  • Acceso a todas las actualizaciones de software, versiones de mantenimiento, correcciones de errores y parches de seguridad
  • Ayuda con soluciones temporales para errores confirmados

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Contacto: parabricks-support@nvidia.com

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Clara Parabricks se puede configurar en solo 10 minutos con una prueba gratuita de 90 días. Mira un breve video para obtener un tutorial paso a paso u obtén más información sobre el conjunto de software y las herramientas disponibles en la documentación técnica de Parabricks.

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