NVIDIA Clara Parabricks

Análisis Integral del Secuenciamiento Genómico

Del DNA al RNA, NVIDIA Clara Parabricks ofrece una potente aceleración para los análisis primarios, secundarios y terciarios de los datos genómicos. Esto es posible gracias al software listo para usarse que se diseñó para los laboratorios de alta productividad en las instalaciones o en cloud, y un conjunto de tecnología que les brinda a los desarrolladores la capacidad de desarrollar potentes herramientas de procesamiento para las tareas de genómica.

Acelerar el Análisis Genómico

  • Para los Laboratorios de Alta Productividad
  • Para Desarrolladores
Clara Parabricks Pipelines

Clara Parabricks Pipelines

NVIDIA Clara Parabricks Pipelines es un conjunto software acelerado por GPU listo para usarse, que se basa en el Conjunto de Herramientas de Análisis Genómico (GATK) del Instituto Broad y está orientado a la identificación de variantes en la línea germinal del ADN para la genómica de poblaciones, la identificación de variantes en las células somáticas del ADN para la genómica del cáncer y los proyectos de secuenciamiento del ARN desde todo el transcriptoma hasta el análisis de una sola célula.

Clara Parabricks Pipelines se optimizó para la velocidad, la precisión y la escalabilidad, dado que puede ejecutar GATK4.1 Best Practices y es completamente configurable. De esta manera, los usuarios pueden elegir los pasos, las configuraciones de parámetros y las versiones del proceso que desean ejecutar.

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Productividad y Rendimiento Incomparables del Análisis Secundario

Clara Parabricks Pipelines se ejecuta en NVIDIA A100 Tensor Cores y ofrece un rendimiento incomparable para reducir el tiempo de análisis a 20minutos para la identificación de variantes en la línea germinal del ADN. Con la aceleración por GPU, los usuarios pueden aprovechar una reducción en los costos de procesamiento en cloud de hasta el 50%, en comparación con las soluciones que usan solo CPU.

Rendimiento de Soluciones con GPU y solo con CPU

Razones para Usar Clara Parabricks Pipelines

Es Fácil de Comenzar a Usar

Clara Parabricks Pipelines se puede configurar en 10 minutos. Usa este detallado video tutorial para comenzar a experimentar el análisis de alta productividad en proyectos de secuenciamiento de ADN y ARN.

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Diagnósticos Más Rápidos. Mejores Resultados de Tratamientos.

Clara Parabricks Pipelines ofrece resultados más rápidos, en comparación con las soluciones que no están aceleradas por GPU. Conoce la forma en que TGEN usa los resultados obtenidos en el mismo día para investigar toda la secuencia genómica de células saludables y enfermas con el objetivo de determinar la terapia más eficaz y personalizada para cada paciente.

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Mejores Resultados Genómicos

Clara Parabricks Pipelines se ejecuta en cloud o en las instalaciones para comprender mejor y más rápido las pandemias virales como COVID-19, desde la evolución del virus hasta la respuesta y la susceptibilidad de los humanos. Mira el video para obtener más información.

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Usuarios de Clara Parabricks Pipelines

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population-genome-program
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personalis
tgen
institute-of-medical-science-university-of-tokyo
national-taiwan-university-hospital

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Clara Parabricks Toolkit

Clara Parabricks Toolkit

NVIDIA Clara Parabricks Toolkit es una colección de aplicaciones de código abierto, aplicaciones de referencia y bibliotecas en el edge aceleradas por GPU. Se diseñó para que los desarrolladores creen workflows asistidos por IA para el análisis genómico. Gracias a este conjunto de herramientas, pueden optimizar el mapeo, la asignación y el ajuste de conjuntos de genomas de novo y mejorar la resolución de la epigenómica de células únicas.

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Noticias

Nuevas Funciones. Más Aceleración.

Gracias a la versión más reciente de NVIDIA Clara Parabricks Pipelines 3.0, los usuarios disfrutarán de un 30% de aumento en el rendimiento, accederán a un nuevo proceso de análisis de ARN y podrán ejecutar el conjunto de software en cloud, mediante la plataforma DNAnexus.

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La Supercomputadora Artemis se Utiliza en Tareas de Genómica de Poblaciones y COVID-19

Gracias a la tecnología de NVIDIA DGX™ y NVIDIA Clara Parabricks, la supercomputadora Artemis trabaja para entender mejor los genomas de los ciudadanos de Abu Dhabi y así mejorar la atención de la salud en el país.

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