NVIDIA Clara Parabricks

Análise Completa de Sequenciamento de Genomas

Do DNA ao RNA, o NVIDIA Clara™ Parabricks oferece aceleração avançada para análises primárias, secundárias e terciárias de dados de genoma. Ele faz isso com um software completo projetado para laboratórios com alta taxa de transferência em instalações ou no cloud e um conjunto de tecnologias que proporciona aos desenvolvedores a capacidade de criar poderosas ferramentas de computação para a genômica.

Aceleração da Análise de Genoma

  • Para Laboratórios com Alta Taxa de Transferência
  • Para Desenvolvedores
Clara Parabricks Pipelines

Clara Parabricks Pipelines

Baseado no Genome Analysis Toolkit (GATK), do Broad Institute, o NVIDIA Clara Parabricks Pipelines é um pacote de softwares pronto para execução e acelerado por GPU para a chamada de variante de linha germinal de DNA para genômica da população, chamada de variante somática de DNA para genômica de câncer e projetos de sequenciamento de RNA de transcriptoma completo a análise de célula única.

Otimizado para velocidade, precisão e escalabilidade, o Clara Parabricks Pipelines pode executar as práticas recomendadas do GATK 4.1 e é totalmente configurável, permitindo que os usuários escolham quais etapas, configurações de parâmetros e versões do pipeline serão executadas.

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Desempenho e Taxa de Transferência de Análise Secundária Inigualáveis

Executado em GPUs NVIDIA A100 Tensor Core, o Clara Parabricks Pipelines oferece desempenho sem precedentes, diminuindo o tempo de análise em até 20 minutos para a chamada de variante de linha germinal de DNA. Com a aceleração de GPU, os usuários também podem aproveitar os custos de computação no cloud reduzidos em até 50% quando comparados a soluções apenas de CPU.

Desempenho de GPU vs. Apenas de CPU

Desempenho de Análise Secundária Completa da Linha Germinal

Por que Usar o Clara Parabricks Pipelines

Fácil de Começar

Fácil de Começar

O Clara Parabricks Pipelines pode ser configurado em 10 minutos. Use este vídeo tutorial passo a passo e aproveite uma análise de alta taxa de transferência para projetos de sequenciamento de DNA e RNA.

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Diagnóstico Mais Rápido. Melhores Resultados de Tratamento.

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O Clara Parabricks Pipelines retorna resultados mais rápido do que soluções não aceleradas por GPU. Saiba como a TGEN usa resultados do mesmo dia para investigar toda a sequência de genoma de células saudáveis e doentes para determinar melhor a terapia mais eficiente e personalizada para cada paciente.

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Melhores Percepções de Genoma

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Em execução no cloud ou no local, o Clara Parabricks Pipelines pode ajudar os pesquisadores a entender melhor e mais rapidamente pandemias virais como a COVID-19, desde a evolução do vírus até a reação e a suscetibilidade humanas. Assista para saber como fazer isso.

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Quem Usa o Clara Parabricks Pipelines

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Clara Parabricks Toolkit

Clara Parabricks Toolkit

Uma coleção de bibliotecas do edge aceleradas por GPU, aplicações de referência e aplicações de código aberto, o NVIDIA Clara Parabricks Toolkit foi criado para os desenvolvedores construírem workflows assistidos por AI para análise de genoma. Com o Toolkit, eles podem otimizar o mapeamento, o alinhamento e o aperfeiçoamento da montagem de novo de genoma e aprimorar a resolução de epigenômica de célula única.

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Notícias

Novos Recursos. Velocidades Mais Rápidas.

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Com o lançamento mais atual do NVIDIA Clara Parabricks Pipelines 3.0, os usuários podem se beneficiar de um aumento de desempenho de 30%, acessar um novo pipeline de análise de RNA e iniciar o pacote de software no cloud na plataforma DNAnexus.

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O Supercomputador Artemis Enfrenta a Genômica Populacional e a COVID-19

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