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Análise Acelerada de Sequenciamento de Genomas

Teste o sequenciamento de DNA e RNA de alta taxa de transferência e alta precisão com análise acelerada por GPU.

Faça Download

NVIDIA Clara^™ Parabricks^® é o único kit de ferramentas de genômica computacional acelerada por GPU que fornece análises rápidas e precisas para centros de seqüenciamento, equipes clínicas, pesquisadores de genômica e desenvolvedores de instrumentos de seqüenciamento de próxima geração.

Ver Documento: Parabrocks Ficha de produto (PDF de 304kB)

Acelere aplicações com as melhores ferramentas da categoria.

Use ferramentas aceleradas para análise germinal, somática e de RNA padrão-ouro, em alta velocidade.

Obtenha desempenho até 80 vezes mais rápido.

Experimente até 80 vezes mais acelerações em relação às soluções somente de CPU, reduzindo os custos de computação em até 50%.

Aumente a precisão na análise de sequenciamento.

Leve o poder do deep learning para sua análise genômica com o Clara Parabricks e as GPUs.

Aproveite workflows flexíveis.

Crie workflows personalizados configurando ferramentas na Linguagem de Descrição de Workflow (WDL - Workflow Description Language) e no NextFlow.

Acelerar a Análise Genômica de Ponta a Ponta

Use Ferramentas Gold-Standard

O Clara Parabricks oferece versões aceleradas por GPU de ferramentas usadas todos os dias por biólogos computacionais e bioinformáticos, possibilitando tempos de execução significativamente mais rápidos, escalabilidade de workflows e custos de computação mais baixos.

Isso inclui compatibilidade total com idiomas e gerentes de workflow (WDL, NextFlow, Cromwell) para interligar facilmente tarefas com tecnologia de GPU e CPU, bem como suporte para fácil implantação no cloud (AWS, GCP, Terra e DNAnexus).

Do FASTQ ao Binary Alignment Map (BAM) e ao VCF

Experiência de Desempenho Inigualável

Do FastQ ao Variant Call Format (VCF), o Clara Parabricks acelera o tempo de execução em uma série de configurações de hardware com GPUs NVIDIA A100 Tensor Core. Os pesquisadores de genômica podem obter aceleração em todas as etapas de seus workflows de análise, do alinhamento à classificação e à identificação de variantes. Quando se usam mais GPUs, observa-se um dimensionamento quase linear nos tempos de computação, ao contrário dos sistemas apenas com CPU, permitindo uma aceleração de 80 vezes.

Analise um Genoma Humano Inteiro com Cobertura 30 Vezes Maior em Menos de 30 Minutos

Os tempos de execução da NVIDIA foram alcançados em um sistema equipado com uma NVIDIA DGX™ A100 de 320GB. Todas as análises foram realizadas no HG002 Genome In A Bottle (GIAB NIST) sequenciado para cobertura 30 vezes maior, com a identificação de variantes realizada com GATKv4.1.0 HaplotypeCaller.

Comece com NVIDIA Clara Parabricks

Encontre o caminho certo para você.

Pesquisa

NVIDIA Clara Parabricks está disponível como um conjunto de containers e modelos pré-treinados da NVIDIA NGC. Baixe NVIDIA Clara Parabricks e confira a documentação e os fluxos de trabalho para ajudá-lo a começar.

Enterprise

Use NVIDIA Clara Parabricks com o software NVIDIA AI Enterprise para obter acesso total ao suporte empresarial que fornece tempos de resposta garantidos, notificações de segurança prioritárias e especialistas em IA da NVIDIA. Para saber mais, entre em contato com o departamento de vendas.

Saiba Mais

Implantar Localmente, no Cloud e no Edge

Construir no Local

Executado em uma NVIDIA DGX™ A100, o Clara Parabricks analisa até 25 mil genomas completos por ano (cobertura de 30 vezes) com as práticas recomendadas do Genomic Analysis Toolkit (GATK) e o dimensionamento da taxa de transferência linearmente além de um única DGX A100.

Saiba Mais sobre a DGX A100

Implantar no Cloud

No cloud, tempo é dinheiro. Escolha uma de várias instâncias de GPU capazes de analisar genomas em questão de minutos. Para facilitar a implantação, vários provedores de cloud hospedam o Clara Parabricks como uma imagem pronta para uso para uso imediato.

Explore o AWS Marketplace

Explore o Google Cloud Platform (GCP)

Explore o Terra

Leve AI ao Edge

Colaboramos com fabricantes de instrumentos de genômica para permitir a criação de sequenciadores de DNA, transcriptômica espacial e outros dispositivos "ômicos" habilitados por AI, melhorando a precisão e possibilitando a análise em tempo real no edge.

Entre em Contato com a Equipe de Genômica da NVIDIA para Saber Mais

Jornada Rápida de Viagem AI com o NVIDIA LaunchPad

Obtenha acesso imediato a soluções empresariais da NVIDIA com um laboratório prático gratuito no Clara Parabricks para análise genômica acelerada.

Comece Agora

Fazendo um Impacto no Mundo Real

Análise em Escala
Em Sequenciadores e Dispositivos
Para Pesquisa de Ponta

The Broad Institute

A NVIDIA está colaborando com a Broad para levar o Parabricks acelerado por GPU à Plataforma Terra, além de otimizar workflows acelerados por AI e grandes modelos de linguagem para avançar as descobertas.

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National Biobank of Thailand Acelera Descobertas Genômicas

National Biobank of Thailand (NBT)

Com a NVIDIA DGX A100 e o Clara Parabricks, o NBT reduziu em quatro meses o tempo de processamento de dados de sequenciamento de genomas completos, e o tempo de processamento por usuário individual passou de mais de 30 horas para apenas 1 a 2 horas.

Leia o Artigo

Translational Genomics Research Institute (TGen)

O Human Genome Center (HGC)

O HGC da Universidade de Tóquio anunciou uma nova plataforma de genômica para acelerar a análise genômica em 40 vezes em comparação a um ambiente baseado em CPU usando o software de genômica NVIDIA Clara Parabricks Pipelines.

Leia o Blog

Regeneron Genetics Center

A Regeneron está usando o DeepVariant com o Clara Parabricks para gerar dados dimensionáveis de alta qualidade que podem ser reproduzidos pela comunidade de genômica.

Assista ao Webinar

Ultima

A Ultima Genomics está colaborando com a NVIDIA para oferecer sequenciamento de genomas a US$100 com AI e computação acelerada.

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Singular

A Singular Genomics está colaborando com a NVIDIA para oferecer sequenciamento e velocidades de análise líderes de mercado e de última geração.

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Dispositivo MinIT com tecnologia NVIDIA AGX

Oxford Nanopore

A Oxford Nanopore está atualizando sua torre de computação PromethION, da tecnologia NVIDIA V100 a A100. Esse aumento de energia de processamento permitirá que ela acompanhe chamadas de base de alta precisão e expanda significativamente a capacidade de algoritmos extremamente precisos.

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Crédito da imagem: Steve Fisch, cortesia da Universidade de Stanford.

Recorde Mundial

Uma equipe de pesquisadores atingiu um novo recorde de sequenciamento de DNA: cinco horas e dois minutos, o que permitirá que os médicos tirem sangue de um paciente em estado crítico e obtenham um diagnóstico de doença genética no mesmo dia.

Leia o Blog

Sequenciamento de Genomas Super-rápido em Tratamento Crítico da Nanopore

Universidade de Stanford, Google e Oxford Nanopore

A Stanford demonstrou enormes reduções no tempo de execução, integrando a implementação acelerada por GPU do DeepVariant disponível com o NVIDIA Clara Parabricks.

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Framework de computação acelerada por GPU para variantes genômicas patogênicas

Universidade Purdue

Os pesquisadores da Purdue concluíram um estudo que avalia o desempenho e a precisão de um framework de computação acelerado por GPU para a identificação de variantes genômicas patogênicas.

Leia o Artigo

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