Análise Completa de Sequenciamento de Genomas
Do DNA ao RNA, o NVIDIA Clara™ Parabricks oferece aceleração avançada para análises primárias, secundárias e terciárias de dados de genoma. Ele faz isso com um software completo projetado para laboratórios com alta taxa de transferência em instalações ou no cloud e um conjunto de tecnologias que proporciona aos desenvolvedores a capacidade de criar poderosas ferramentas de computação para a genômica.
Baseado no Genome Analysis Toolkit (GATK), do Broad Institute, o NVIDIA Clara Parabricks Pipelines é um pacote de softwares pronto para execução e acelerado por GPU para a chamada de variante de linha germinal de DNA para genômica da população, chamada de variante somática de DNA para genômica de câncer e projetos de sequenciamento de RNA de transcriptoma completo a análise de célula única.
Otimizado para velocidade, precisão e escalabilidade, o Clara Parabricks Pipelines pode executar as práticas recomendadas do GATK 4.1 e é totalmente configurável, permitindo que os usuários escolham quais etapas, configurações de parâmetros e versões do pipeline serão executadas.
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Executado em GPUs NVIDIA A100 Tensor Core, o Clara Parabricks Pipelines oferece desempenho sem precedentes, diminuindo o tempo de análise em até 20 minutos para a chamada de variante de linha germinal de DNA. Com a aceleração de GPU, os usuários também podem aproveitar os custos de computação no cloud reduzidos em até 50% quando comparados a soluções apenas de CPU.
Desempenho de GPU vs. Apenas de CPU
Desempenho de Análise Secundária Completa da Linha Germinal
O Clara Parabricks Pipelines pode ser configurado em 10 minutos. Use este vídeo tutorial passo a passo e aproveite uma análise de alta taxa de transferência para projetos de sequenciamento de DNA e RNA.
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O Clara Parabricks Pipelines retorna resultados mais rápido do que soluções não aceleradas por GPU. Saiba como a TGEN usa resultados do mesmo dia para investigar toda a sequência de genoma de células saudáveis e doentes para determinar melhor a terapia mais eficiente e personalizada para cada paciente.
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Em execução no cloud ou no local, o Clara Parabricks Pipelines pode ajudar os pesquisadores a entender melhor e mais rapidamente pandemias virais como a COVID-19, desde a evolução do vírus até a reação e a suscetibilidade humanas. Assista para saber como fazer isso.
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Uma coleção de bibliotecas do edge aceleradas por GPU, aplicações de referência e aplicações de código aberto, o Kit de Ferramentas NVIDIA Clara Parabricks foi criado para os desenvolvedores construírem workflows assistidos por AI para análise de genoma. Com o Kit de Ferramentas, eles podem otimizar o mapeamento, o alinhamento e o aperfeiçoamento da montagem de novo de genoma e aprimorar a resolução de epigenômica de célula única.
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