Análise Acelerada de Sequenciamento de Genomas Completos

Experimente o sequenciamento de DNA e RNA de alto rendimento e alta precisão com o NVIDIA Clara Parabricks.

Teste Gratuito de 90 Dias

Faça análises de genomas mais rápidas e mais precisas com o NVIDIA Clara™ Parabricks. O Clara Parabricks é um framework de aplicação de genômica computacional acelerada por GPU que fornece análises precisas e aceleradas de dados de sequenciamento de próxima geração para pesquisadores, equipes clínicas e centros médicos e de sequenciamento de câncer e doenças genéticas.

Veja o Documento: Especificações do Produto Parabricks (PDF de 304kB)
Alto Rendimento

Alto Rendimento

Processe até 60 genomas completos por dia em um único servidor.

Mais Precisão

Mais Precisão

Não é preciso sacrificar a precisão para reduzir o tempo de resposta. Está disponível um conjunto de mecanismos de identificação de células germinais e somáticas.

Pipelines Flexíveis

Pipelines Flexíveis

Crie pipelines personalizados e acelerados configurando mais de 33 ferramentas para qualquer necessidade específica de pipeline ou aplicação.

30 a 60 Vezes Mais Rápido

30 a 60 Vezes Mais Rápido

Reduza os custos de computação em até 50% com uma execução de 30 a 60 vezes mais rápida que soluções exclusivas de CPU.

Oferecendo Desempenho Acelerado por GPU em Bioinformática

Acelere pipelines de ponta a ponta, do FastQ ao Variant Call Format (VCF), para um genoma inteiro em 23 minutos ou um exoma inteiro em 3 minutos.

Os dados foram gerados usando informações disponíveis ao público para NA 12878 depreciando dados para uma cobertura de 30 vezes. Para o tempo de execução de 23 minutos, foi usada a DGX A100 com memória de 320GB. Os números nativos do GATK4.1 foram gerados usando 32 vCPUs [Intel Xeon® Platinum 8175M de 3.1GHz] e 128GB de RAM.

Operando com Mais Rapidez e Mais Facilidade

O desempenho do REDCINE-X PRO mede a média geométrica de FPS em vídeos em 6K e 8K.

Aplicações Aceleradas para Análise Genômica

Do FASTQ ao Binary Alignment Map (BAM) e ao VCF, a NVIDIA acelera a análise genômica para workflows de variantes somáticas, germinais e estruturais, além de aumentar a velocidade de sequenciamento e a precisão de leitura e consenso da chamada de bases.

Do FASTQ ao Binary Alignment Map (BAM) e ao VCF

Sequenciamento de Próxima Geração on Premise ou no Cloud

Para executar o NVIDIA Clara Parabricks, são necessárias pelo menos duas GPUs. As licenças on premise são assinaturas anuais por GPU que oferecem acesso completo a todos os pipelines do pacote de software NVIDIA Clara Parabricks.

NVIDIA DGX A100

Soluções on Premise

Executado em uma NVIDIA DGX™ A100, o Clara Parabricks analisa até 25 mil genomas completos ao ano (cobertura de 30 vezes) com o Genomic Analysis Toolkit (GATK) do Broad Institute. A partir de uma DGX A100, o rendimento é dimensionado linearmente.

Saiba mais sobre a DGX A100

No Cloud

No cloud, tempo é dinheiro. Escolha uma de várias instâncias de GPU capazes de analisar genomas em questão de minutos. Para facilitar a implantação, o AWS tem o Clara Parabricks disponível em uma imagem de máquina da Amazon (AMI - Amazon Machine Image) para uso imediato.

Conheça o AWS Marketplace
AWS Marketplace: Pipelines NVIDIA Clara Parabricks

Como o Clara Parabricks Está Causando Impacto Verdadeiro

DeepVariant com o Clara Parabricks

Regeneron Genetics Center

Veja como a Regeneron está usando o DeepVariant com o Clara Parabricks para gerar dados dimensionáveis de alta qualidade que podem ser reproduzidos pela comunidade de genômica.

Assista ao Webinar
NVIDIA DGX A100 e Clara Parabricks

National Biobank of Thailand (NBT)

Com a NVIDIA DGX A100 e o Clara Parabricks, o NBT reduziu em 4 meses o processamento de dados de sequenciamento de genomas completos, e o tempo de processamento por usuário individual passou de mais de 30 horas para apenas 1 ou 2 horas.

Leia o Artigo
GPUs NVIDIA V100 Tensor Core

Translational Genomics Research Institute (TGen)

Com o NVIDIA Clara Parabricks e as GPUs NVIDIA V100 Tensor Core, o TGen acelerou a análise de sequenciamento genômico em 6 vezes para ajudar a criar tratamentos personalizados para crianças com condições neurológicas raras.

Leia o Caso de Sucesso
NVIDIA Clara Parabricks

Washington University in Saint Louis (WUSTL)

A integração de etapas baseadas em GPU com o NVIDIA Clara Parabricks permitiu que Tychele Turner, da WUSTL, reduzisse significativamente o tempo de execução de chamadas de variantes de novo.

Assista ao Webinar

Recursos

  • Suporte Empresarial
  • Documentação

Os Serviços de Suporte de Pipelines Parabricks são uma forma fácil e confiável de aumentar a produtividade e reduzir o tempo de inatividade de sistemas de análise de produção. Os Serviços de Suporte da NVIDIA para Parabricks incluem:

  • Comunicação direta com especialistas e técnicos da NVIDIA
  • Auxílio com instalação e uso de Pipelines Parabricks
  • Resposta rápida e resolução ágil de problemas (os casos são aceitos para suporte remoto 24 horas por dia)
  • Acesso a todos os upgrades de software, versões de manutenção, correções de bugs e patches de segurança
  • Auxílio com soluções temporárias para bugs confirmados

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Entre em contato pelo endereço parabricks-support@nvidia.com

Introdução

Com o teste gratuito de 90 dias, o Clara Parabricks pode ser configurado para uso em apenas 10 minutos. Assista a um vídeo curto para conferir o passo a passo ou saiba mais sobre o pacote de softwares e ferramentas disponíveis na documentação técnica do Parabricks.

Faça um teste gratuito de 90 dias do NVIDIA Clara Parabricks hoje mesmo ou entre em contato com a equipe de vendas para solicitar um orçamento.

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