Una pietra miliare della tecnologia a lunga lettura di PacBio è l'elevata precisione, qualità e copertura dei genomi. Ciò si manifesta nel suo sequenziamento a lunga lettura ad alta fedeltà (HiFi), un potente strumento utilizzato per studiare grandi caratteristiche genomiche o trascrittomiche a livello di singola molecola di DNA o RNA. Un aspetto essenziale della generazione di dati a lunga lettura è il processo di chiamata base, che è cruciale per determinare le sequenze nucleotidiche di molecole di DNA lunghe e complesse. Tuttavia, ciò richiede notevoli risorse computazionali, data la necessità di generare una sequenza di consenso per ciascuna molecola, un processo che viene poi eseguito su milioni di molecole.
Il sequenziatore a lunga lettura Sequel IIe di PacBio è stato progettato con calcolo basato sulla CPU. Sebbene funzionale, ha raggiunto una soglia di prestazioni che ha limitato l'ottimale in tutto e, quindi, la sua utilità per i clienti commerciali. Per affrontare questo limite, PacBio ha introdotto il sistema Revio con GPU NVIDIA A100. Questo progresso ha consentito un aumento significativo della potenza di calcolo all'interno della stessa dimensione del dispositivo. Come risultato di questa transizione alle GPU NVIDIA, insieme a NVIDIA® CUDA® per l'ottimizzazione del codice, PacBio è stato in grado di accelerare le chiamate di base, con conseguente throughput complessivo ed efficienza del processo di sequenziamento.
Queste tecnologie hanno anche accelerato in modo notevole il sequenziamento del consenso circolare (CCS) sul sistema Revio. Il sequenziamento ripetuto di molecole di DNA circolarizzate per generare letture ad alta precisione ha richiesto una potenza di elaborazione e un tempo sostanziali, limitando il throughput complessivo e l'efficienza del sequenziatore. Con Revio che utilizza GPU NVIDIA, PacBio è stato in grado di ridurre il processo CCS da oltre 15 ore a 2,5 ore, traducendosi in risparmi di tempo, una maggiore produttività e una maggiore fattibilità commerciale della sequenza di Revio per i clienti.