Acelerando Pipelines de Descoberta de Medicamentos com IA
Plataforma de Desenvolvimento para Biologia e Descoberta de Medicamentos Orientadas por IA
NVIDIA CLARA
Crie com Modelos e Conjuntos de Dados de IA de Código Aberto
NVIDIA Clara™ é uma família de modelos de base de IA de código aberto, ferramentas e receitas para pesquisa biomédica. O Clara inclui modelos de base de IA para ômica, estruturas de proteínas e moléculas, imagens, anatomia 3D, robótica cirúrgica e gêmeos digitais para simulações informadas por física. Eles são criados usando os principais conjuntos de dados clínicos, de imagens e biológicos abertos.
O Clara se integra diretamente ao stack de software de IA da NVIDIA. Ele está completo com checkpoints pré-treinados e novas arquiteturas de modelos, receitas de treinamento, conjuntos de dados abertos e ferramentas selecionadas, além de frameworks unificados de benchmarking e avaliação.
Framework e Receitas NVIDIA BioNeMo
Treine e Personalize Modelos para Biofarmacêutica
O NVIDIA BioNeMo™ Framework é um framework de código aberto para criação e treinamento de modelos de deep learning para biopharma com machine learning.
Ao acelerar os aspectos mais caros e prolongados do desenvolvimento de modelos de IA, os criadores de modelos de IA que fazem pesquisas biomoleculares com dados de DNA, RNA e proteínas podem acessar ferramentas para levar suas pesquisas a novos patamares.
A plataforma inclui receitas de treinamento selecionadas, carregadores de dados e exemplos de arquitetura de modelos de IA pré-treinados e otimizados, que são específicos para certos domínios e acelerados para o melhor desempenho, tornando a criação de modelos de IA mais rápida e simples.
NVIDIA AI Blueprints
Crie Aplicações de IA Generativa para Descoberta de Medicamentos com Workflows de IA Pré-treinados
Os NVIDIA BioNeMo Blueprints são workflows de referência pré-treinados projetados para aplicações de IA generativa na descoberta de medicamentos, oferecendo às equipes de biofarmacêutica uma base para acelerar a pesquisa e a inovação.
Para empresas do setor biofarmacêutico que buscam integrar a IA, esses blueprints incluem código de referência, ferramentas e documentação abrangente para personalizar e implantar workflows adaptados a dados proprietários e pipelines terapêuticos exclusivos.
Esses volantes de dados resultantes melhoram o desempenho do modelo ao longo do tempo, impulsionando insights mais profundos e acelerando a descoberta. Os BioNeMo Blueprints permitem que as equipes de biofarmácia simplifiquem a inovação e liberem o potencial da IA no desenvolvimento de medicamentos.
Microsserviços NVIDIA NIM
Inferência de IA Otimizada para Aplicações Escalonáveis de Descoberta de Medicamentos
O NVIDIA BioNeMo NIM™ inclui um conjunto de microsserviços de IA otimizados e fáceis de usar que permitem inferência em gigaescala e novos recursos no design de medicamentos.
Criados para desenvolvedores de plataformas de descoberta computacional de medicamentos e cientistas de dados, os microsserviços NIM são construídos como contêineres, fornecendo tudo que é necessário para a implantação mais eficiente e portátil disponível, incluindo fácil integração de APIs em aplicações de IA de nível empresarial.
Os microsserviços NIM aumentam a eficiência e a inovação dos workflows de descoberta de medicamentos, diminuindo o custo total e o tempo de lançamento no mercado para descobertas orientadas por IA.
NVIDIA CUDA-X para Biofarmacêutica
Ferramentas e Bibliotecas Aceleradas por GPU para IA Molecular
As bibliotecas NVIDIA CUDA-X™ oferecem módulos de código drop-in que aceleram as camadas com uso mais intensivo de computação nos modelos de IA biomolecular atuais para que os pesquisadores possam inovar mais rapidamente.
O cuEquivariance é uma biblioteca NVIDIA Python projetada para facilitar a construção de redes neurais equivalentes de alto desempenho usando produtos de tensores segmentados. O cuEquivariance também otimizou kernels para atenção a triângulos e multiplicação de triângulos para modelar interações em pares em previsão de estrutura de proteínas (por exemplo, arquiteturas no estilo AlphaFold).
As alterações de código em uma linha e as integrações prontas por meio das ligações PyTorch e Jax facilitam a substituição dos passos mais caros em um Workflow por kernels otimizados para CUDA®.
O cuEquivariance desbloqueia novos níveis de desempenho em modelos de estrutura de proteínas, química generativa e dinâmica molecular.
Tecnologias Adicionais
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Documentação
Encontre uma coleção de documentos, guias, manuais, instruções e muito mais no Hub de Documentação do NVIDIA BioNeMo.
Atualizações do Produto
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Perguntas Frequentes
O NVIDIA BioNeMo é uma plataforma de desenvolvimento aberta para biologia e descoberta de medicamentos orientada por IA. Ele reúne modelos abertos, ferramentas e conjuntos de dados em todo o ciclo de vida, permitindo que pesquisadores e desenvolvedores criem, personalizem e implantem aplicações de IA para pesquisa biológica e descoberta de medicamentos. O BioNeMo permite workflows de laboratório que fecham o loop de feedback entre experimentação e IA, usando dados experimentais para melhorar continuamente a inteligência de modelos, previsões e insights científicos.
- O NVIDIA BioNeMo Framework é uma coleção de ferramentas e bibliotecas de programação que simplificam a criação de modelos de IA biomolecular, acelerando as etapas mais demoradas e dispendiosas da descoberta computacional de medicamentos.
- O NVIDIA NIM é um conjunto de microsserviços portáteis e otimizados, fáceis de usar e projetados para cientistas biomoleculares em descoberta de medicamentos que precisam de inferência de modelos de IA segura e confiável.
NVIDIA BioNeMo Framework: os usuários podem acessar o BioNeMo framework de duas maneiras. A oferta da NVIDIA para uso em nível empresarial do BioNeMo com uma licença da NVIDIA Enterprise inclui o contêiner BioNeMo por meio do catálogo NVIDIA NGC™, que fornece aos desenvolvedores empresariais e pesquisadores uma cadeia de ferramentas segura e escalável para criar workflows biomoleculares. A versão de código aberto do BioNeMo usada por pesquisadores e cientistas de dados está disponível para instalação no GitHub, incluindo todos os seus componentes.
Modelos pré-treinados: o BioNeMo framework oferece receitas BioNeMo que mostram exemplos de implementação de arquitetura compatível com o Transformer Engine e também permitem testes e ajuste fino. Os usuários são encorajados a estender suas próprias implementações usando as receitas do BioNeMo como tutoriais.
Os microsserviços BioNeMo NIM oferecem vários pontos de verificação otimizados, como Evo2 (IA generativa genômica), GenMol (geração de moléculas), DiffDock (docking) e outros, cada um apoiando suas respectivas tarefas biomoleculares.
Veja a lista mais recente de requisitos de sistema para o Framework BioNeMo na página de Contêineres do Catálogo NGC.
Veja os requisitos mais recentes do sistema para microsserviços NIM na documentação da API da NVIDIA.
O código do BioNeMo framework é licenciado pelo Apache 2.0, enquanto os contêineres oficiais NGC são regidos pelo Contrato de Produtos de IA da NVIDIA (e podem ser cobertos por uma licença da NVIDIA AI Enterprise para uso comercial).
O NVIDIA BioNeMo expõe seus modelos por meio de bibliotecas, APIs e microsserviços NIM em contêineres, permitindo que as equipes chamem predição de estrutura, química generativa e outras funções diretamente de seus frameworks estabelecidos de descoberta de medicamentos.
Lance o contêiner BioNeMo Framework ou clone o repositório GitHub, aponte uma configuração do YAML para seus dados, adicione um restore_from_path (ou equivalente) para carregar pesos existentes e execute o script de treinamento fornecido para pré-treinar ou ajustar um modelo.
Como o BioNeMo Framework está hospedado abertamente no GitHub, os desenvolvedores podem criar um fork do repositório e enviar solicitações de acesso de acordo com as diretrizes "CONTRIBUTING" da documentação do repositório para adicionar novo código.
Entre em contato conosco com sua pergunta.
Além disso, os usuários podem acessar documentação, tutoriais e um fórum de ativo por meio do Hub de Recursos BioNeMo, enquanto os clientes empresariais podem abrir tíquetes de suporte por meio do NVIDIA AI Enterprise.