BioNeMo semplifica l'uso di modelli pre-addestrati, downloader automatici e preprocessori per database UniRef50 e ZINC. Vari modelli, incorporazioni e output possono essere combinati per riunire dati multimodali, grazie a learner strutturati non supervisionati. Il pre-training senza supervisione elimina anche la necessità di dati etichettati, creando una generazione di integrazioni apprese per prevedere la struttura proteica, la funzione, la posizione cellulare, l'imprevedibilità dell'acqua, il legame a membrana, le regioni conservanti e variabili e altro ancora.