NVIDIA Clara Parabricks

엔드 투 엔드 유전자 서열 분석

NVIDIA Clara™ Parabricks는 DNA부터 RNA에 이르는 유전자 데이터의 1차, 2차 및 3차 분석에 강력한 가속 효과를 제공합니다. 온프레미스 또는 클라우드 상의 고처리량 실험실을 위해 설계된 턴키 소프트웨어와, 개발자가 강력한 유전체 연산 도구를 구축할 수 있도록 해주는 기술 스택을 통해 이를 수행합니다.

유전자 분석 가속화

  • 고처리량 실험실용
  • 개발자용
Clara Parabricks Pipelines

Clara Parabricks Pipelines

Broad Institute의 유전자 분석 툴킷(GATK) 기반의 NVIDIA Clara Parabricks Pipelines는 바로 실행 가능한 GPU 가속 소프트웨어로, 다음 용도에 적합합니다:

개체군 유전체학을 위한 DNA 생식 계열 변이 검출
암 유전체학 및 종양변이부담(TMB)을 위한 DNA 체세포 변이 검출
전체 전사체부터 단일 세포 분석에 이르는 RNA 시퀀싱 프로젝트
딥 뉴럴 네트워크를 사용한 변이 검출을 지원하는 Google의 DeepVariant

속도, 정확도, 확장성에 최적화된 Clara Parabricks Pipelines는 GATK4.1 모범 사례를 실행할 수 있고 완전히 구성 가능하여 사용자는 실행할 단계, 매개변수 설정 및 파이프라인 버전을 선택할 수 있습니다.

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범접할 수 없는 2차 분석 성능 및 처리량

NVIDIA A100 Tensor 코어 GPU에서 실행되는 Clara Parabricks Pipelines는 DNA 생식 계열 변이 검출을 위한 분석 시간을 23분으로 단축하여 유례없는 성능을 제공합니다. GPU 가속화를 통해 사용자는 CPU로만 구성된 솔루션과 비교할 때 클라우드 컴퓨팅 비용을 최대 50% 절감하는 혜택을 누릴 수 있습니다.

성능 비교

생식 계열 엔드 투 엔드 이차 분석

Clara Parabricks Pipelines를 사용해야 하는 이유

간편한 시작

Clara Parabricks Pipelines는 10분 이내에 설정을 마칠 수 있습니다. 이 단계별 지침 비디오를 이용해 DNA 및 RNA 서열 분석 프로젝트를 위한 고처리량 분석을 경험해 보십시오.

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더욱 빠른 진단. 더 향상된 치료 결과.

Clara Parabricks Pipelines는 비 GPU 가속 솔루션보다 더 빠르게 결과를 제공합니다. TGEN이 당일 결과를 사용해 건강한 세포와 질환 세포의 유전체 서열을 조사하여 각 환자에게 맞춤화된 가장 효과적인 요법을 결정하는 방법을 알아보십시오.

성공 사례 보기 ›

향상된 유전체 통찰력

클라우드 또는 온프레미스에서 실행되는 Clara Parabricks Pipelines는 연구자들이 바이러스의 진화부터 인체의 반응과 인체의 감수성에 이르는 코로나19와 같은 바이러스 팬데믹을 더욱 빠르고 심도 있게 이해할 수 있도록 돕습니다. 방법을 알아보려면 시청하십시오.

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Clara Parabricks Pipelines 채택자

tohoku-medical-megabank-organization
population-genome-program
thailand-population-genome-program
personalis
tgen
institute-of-medical-science-university-of-tokyo
national-taiwan-university-hospital

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Clara Parabricks 지원

Parabricks Pipelines Support Services를 통해 쉽고 신뢰할 수 있는 방법으로 프로덕션 분석 시스템의 생산성을 향상하고 가동 중단 시간을 단축할 수 있습니다. NVIDIA의 Parabrick 지원 서비스에 포함되는 내용은 다음과 같습니다.

  • NVIDIA 기술 전문가 및 분야별 전문가와의 직접적인 커뮤니케이션
  • Parabricks Pipelines 설치 및 사용 지원
  • 빠른 대응과 적시의 문제 해결(연중무휴 24시간 원격 지원으로 사례 접수)
  • 모든 소프트웨어 업그레이드, 유지관리 릴리스, 버그 수정 및 보안 패치에 대한 액세스
  • 확인된 버그에 대한 임시 해결책 지원

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더 궁금한 점이 있으신가요?

parabricks-support@nvidia.com 으로 문의하세요.

Clara Parabricks Toolkit

Clara Parabricks Toolkit

CPU 가속 엣지 라이브러리, 참조 애플리케이션, 오픈소스 애플리케이션이 집약된 NVIDIA Clara Parabricks Toolkit은 유전체 분석을 위한 AI 지원 워크플로우를 구축하는 개발자를 위해 고안되었습니다. 이 툴킷을 이용하면 드노보(de novo) 유전체 어셈블리를 위해 매핑, 정렬 및 연마를 최적화하고 단일 세포 후성 유전체의 분해능을 향상할 수 있습니다.

자세히 알아보기 ›

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