Analisi accelerata del sequenziamento del genoma

Scopri il sequenziamento di DNA e RNA ad alta produttività e ad alta precisione con l'analisi accelerata da GPU.

Analisi genomiche più veloci e accurate con NVIDIA Clara Parabricks®, l'unico toolkit di genomica computazionale accelerato da GPU, che offre analisi rapide e accurate per centri di sequenziamento, team clinici, ricercatori di genomica e sviluppatori di strumenti di sequenziamento di nuova generazione. 

Applicazioni chiave

Accelera le applicazioni con strumenti all'avanguardia.

Usa strumenti accelerati per l'analisi germinale, somatica e RNA gold-standard.

Fino a 8 volte più veloce

Prestazioni fino a 80 volte più veloci

Accelera fino a 80 volte le prestazioni rispetto alle soluzioni basate solo su CPU, riducendo i costi di calcolo fino al 50%.

Migliore precisione

Migliora la precisione nell'analisi del sequenziamento.

Porta la potenza del deep learning nell'analisi genomica con Clara Parabricks e le GPU.

Flussi di lavoro flessibili

Sfrutta i flussi di lavoro flessibili.

Crea flussi di lavoro personalizzati configurando gli strumenti in Workflow Description Language (WDL) e NextFlow.

Accelera l'intero ciclo di analisi genomica

Usa strumenti gold-standard.

Clara Parabricks fornisce versioni accelerate da GPU degli strumenti utilizzati ogni giorno da biologi computazionali e bioinformatici, consentendo runtime significativamente più veloci, scalabilità del flusso di lavoro e costi di calcolo più bassi.

Questo include la piena compatibilità con i linguaggi e i gestori dei flussi di lavoro (WDL, NextFlow, Cromwell) per collegare facilmente le attività basate su GPU e CPU, nonché il supporto per una distribuzione cloud semplice (AWS, GCP, Terra e DNAnexus).

Da FASTQ a Binary Alignment Map (BAM) a VCF

Scopri prestazioni senza pari.

Da FastQ a VCF (Variant Call Format), Clara Parabricks accelera i runtime in una serie di configurazioni hardware con GPU NVIDIA A100 Tensor Core. I ricercatori genomici possono sperimentare l'accelerazione in ogni fase dei flussi di lavoro di analisi, dall'allineamento all'ordinamento fino alle chiamate di varianti. Quando si utilizzano più GPU, si osserva una scalabilità quasi lineare nei tempi di elaborazione rispetto ai sistemi basati solo su CPU, consentendo un'accelerazione di oltre 80 volte.

Analizzare un intero genoma umano con una copertura 30 volte superiore in meno di 30 minuti

Distribuisci in locale, nel cloud e sui sistemi periferici.

NVIDIA DGX A100

Crea in locale.

Eseguito su un nodo  NVIDIA DGX™ A100, Clara Parabricks analizza fino a 25.000 genomi interi all'anno (30 volte la copertura) con le best practice del Genomic Analysis Toolkit (GATK) con scalabilità della produttività lineare oltre la singola DGX A100.

Distribuisci nel cloud.

Nel cloud, il tempo è denaro. Scegli tra una gamma di istanze GPU in grado di analizzare i genomi in pochi minuti. Per una distribuzione semplificata, diversi fornitori cloud ospitano Clara Parabricks come immagine pronta all'uso.

Distribuisci nel cloud.
Porta l'IA sui sistemi periferici.

Porta l'IA sui sistemi periferici.

Collaboriamo con i produttori di strumenti genomici per consentire la creazione di sequenziatori di DNA software-defined e basati su IA, per la trascrizione spaziale e altri dispositivi analoghi, migliorando l'accuratezza e abilitando l'analisi in tempo reale sui sistemi periferici.

Accelera il tuo percorso verso l'IA con NVIDIA LaunchPad

Ottieni l'accesso immediato alle soluzioni aziendali NVIDIA con un laboratorio pratico su Clara Parabricks per l'analisi genomica accelerata.

e un impatto reale.

  • Analisi scalabile
  • in sequenziatori e dispositivi
  • per una ricerca all'avanguardia
DeepVariant con Clara Parabricks

The Broad Institute

NVIDIA collabora con Broad per portare Parabricks accelerato da GPU nella piattaforma Terra, oltre a ottimizzare i flussi di lavoro accelerati da IA e grandi modelli linguistici per avanzare nella ricerca.

La National Biobank of Thailand accelera la ricerca genomica

National Biobank of Thailand (NBT)

La NBT è stata in grado di ridurre i tempi di elaborazione dei dati di sequenziamento dell'intero genoma di 4 mesi e i relativi tempi di lavoro per singolo utente da oltre 30 ore a solo 1–2 ore con NVIDIA DGX A100 e Clara Parabricks.

Translational Genomics Research Institute (TGen)

The Human Genome Center (HGC)

L'HGC dell'Università di Tokyo ha annunciato una nuova piattaforma genomica per accelerare l'analisi genomica di 40 volte rispetto a un ambiente basato su CPU, utilizzando il software genomico NVIDIA Clara Parabricks Pipelines. 

Translational Genomics Research Institute (TGen)

Centro di genetica Regeneron

Regeneron utilizza DeepVariant con Clara Parabricks per generare dati scalabili e di alta qualità che possono essere riprodotti in tutta la comunità genomica.

Ultima Genomics collabora con NVIDIA

Ultima

Ultima Genomics collabora con NVIDIA per fornire un sequenziamento del genoma sostenibile con IA e computing accelerato.

Singular Genomics collabora con NVIDIA

Singular

Singular Genomics collabora con NVIDIA per offrire velocità di analisi e sequenziamento leader di mercato di nuova generazione.

Dispositivo MinIT, basato su NVIDIA AGX

Oxford Nanopore

Oxford Nanopore sta potenziando la sua torre di calcolo PromethION, passando dalla tecnologia NVIDIA V100 alla A100. Questo aumento di potenza consentirà di soddisfare le crescenti esigenze di altissima precisione e di espandere notevolmente la capacità di algoritmi super accurati.

Guinness World Record assegnato per il sequenziamento del DNA più veloce
Immagine di: Steve Fisch, gentilmente concessa dalla Stanford University.

Guinness World Record

Un team di ricercatori ha ottenuto un nuovo record di sequenziamento del DNA, cinque ore e due minuti, che consentirà ai medici di prelevare sangue da un paziente critico e raggiungere una diagnosi di malattia genetica lo stesso giorno.

Sequenziamento del genoma con nanopori ultrarapido nei trattamenti critici

Stanford University, Google e Oxford Nanopore

La Stanford ha dimostrato un'enorme riduzione del runtime integrando l'implementazione accelerata da GPU di DeepVariant disponibile con NVIDIA Clara Parabricks.

Framework di calcolo accelerato da GPU per la variante genomica patogena

Purdue University

I ricercatori di Purdue hanno completato uno studio che valuta le prestazioni e l'accuratezza di un framework di calcolo accelerato da GPU per l'identificazione delle varianti genomiche patogene.

Inizia subito con Clara Parabricks.

Usa NVIDIA Clara Parabricks gratis oggi stesso.

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