NVIDIA Clara Parabricks

Analisi avanzata delle sequenze di genoma

Analisi genomiche più veloci e accurate con NVIDIA Clara™ Parabricks. Clara Parabricks, un framework applicativo di genomica computazionale accelerato da GPU, offre un'analisi accurata e accelerata dei dati di sequenziamento di nuova generazione per ricercatori e team clinici, nonché centri medici, oltre al sequenziamento per malattie genetiche e cancro.

Throughput elevato

Throughput elevato

Elabora fino a 60 genomi interi al giorno su un singolo server.

Migliore precisione

Migliore precisione

Non c'è bisogno di sacrificare la precisione per ridurre i tempi di consegna. È disponibile una suite di campioni di linea germinale e somatica.

Flussi flessibili

Flussi flessibili

Crea flussi personalizzati e accelerati configurando oltre 33 strumenti per qualsiasi progetto o applicazione specifica.

30–60 volte più veloce

30–60 volte più veloce

Riduci i costi di elaborazione fino al 50% con un'esecuzione da 30 a 60 volte più veloce rispetto alle soluzioni solo CPU.

Applicazioni accelerate per l'analisi genomica

Da FASTQ a Binary Alignment Map (BAM) a VCF, NVIDIA accelera l'analisi genomica per flussi di lavoro somatici, germinali e varianti strutturali, oltre a migliorare la velocità del sequenziatore e l'accuratezza delle chiamate di base di lettura del consenso.

Da FASTQ a Binary Alignment Map (BAM) a VCF

Sequenziamento di nuova generazione on-premise o nel cloud

L'esecuzione di NVIDIA Clara Parabricks richiede un minimo di due GPU. Le licenze on-premise sono abbonamenti annuali per GPU, che includono l'accesso completo a tutti i flussi della suite software NVIDIA Clara Parabricks.

NVIDIA DGX A100

Soluzioni on-premise

Eseguito su un nodo  NVIDIA DGX™ A100, Clara Parabricks analizza fino a 25.000 genomi interi all'anno (30 volte la copertura) con Genomic Analysis Toolkit (GATK) del Broad Institute. Il throughput scala in modo lineare oltre al singolo DGX A100.

Nel cloud

Nel cloud, il tempo è denaro. Scegli tra una gamma di istanze GPU in grado di analizzare i genomi in pochi minuti. Per una facile distribuzione su AWS, Clara Parabricks è disponibile in un'AMI (Amazon Machine Image) per un uso immediato.

AWS Marketplace: Pipeline NVIDIA Clara Parabricks

L'impatto di Clara Parabricks nel mondo reale

DeepVariant con Clara Parabricks

Centro di genetica Regeneron

Scopri come Regeneron utilizza DeepVariant con Clara Parabricks per generare dati scalabili e di alta qualità che possono essere riprodotti in tutta la comunità genomica.

NVIDIA DGX A100 e Clara Parabricks

National Biobank of Thailand (NBT)

La NBT è stata in grado di ridurre i tempi di elaborazione dei dati di sequenziamento dell'intero genoma di 4 mesi e i relativi tempi di lavoro per singolo utente da oltre 30 ore a solo 1-2 ore con NVIDIA DGX A100 e Clara Parabricks.

GPU NVIDIA V100 Tensor Core

Translational Genomics Research Institute (TGen)

Con NVIDIA Clara Parabricks e le GPU NVIDIA V100 Tensor Core, TGen ha accelerato l'analisi del sequenziamento genomico di 6 volte, per definire trattamenti personalizzati per bambini con disturbi neurologici rari.

NVIDIA Clara Parabricks

Washington University in Saint Louis (WUSTL)

L'integrazione dei passaggi basati su GPU con NVIDIA Clara Parabricks ha permesso a Tychele Turner di WUSTL di ridurre drasticamente il runtime per le mutazioni de novo.

Risorse

  • Supporto aziendale
  • Documentazione

I servizi di supporto Parabricks Pipelines forniscono un modo semplice e affidabile per migliorare la produttività e ridurre i tempi di inattività dei sistemi di analisi della produzione. I servizi di supporto NVIDIA per Parabricks includono:

  • Comunicazione diretta con esperti tecnici e di dominio NVIDIA
  • Guida all'installazione e all'utilizzo di Parabricks Pipelines
  • Risposta e risoluzione rapide dei problemi (i casi sono accettati per il supporto remoto 24 ore su 24, 7 giorni su 7)
  • Accesso a tutti gli aggiornamenti software, i rilasci di manutenzione, le correzioni di bug e le patch di sicurezza
  • Aiuto con le soluzioni transitorie per bug confermati

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Scrivi a parabricks-support@nvidia.com

Per cominciare

Clara Parabricks può essere configurato in 10 minuti, con prova gratuita di 90 giorni. Guarda un breve video con la procedura dettagliata o scopri di più sulla suite software e sugli strumenti disponibili nella documentazione tecnica di Parabricks.

Inizia oggi stesso una prova gratuita di 90 giorni di NVIDIA Clara Parabricks o contatta il nostro team di vendita per ricevere un preventivo.