NVIDIA Clara Parabricks

Análisis de la secuenciación del genoma de extremo a extremo

Potencia un análisis genómico más rápido y preciso con NVIDIA Clara™ Parabricks. Clara Parabricks, un marco de aplicación de genómica computacional acelerada en la GPU, ofrece un análisis preciso y acelerado de datos de secuenciación de próxima generación para investigadores y equipos clínicos, así como centros médicos y de secuenciación para enfermedades genéticas y cáncer.

Alto rendimiento

Alto rendimiento

Procesa hasta 60 genomas completos por día en un solo servidor.

Mejor precisión

Mejor precisión

No hay necesidad de sacrificar la precisión para reducir el tiempo de respuesta. Hay disponible un conjunto de llamadores somáticos y de línea germinal.

Canalizaciones flexibles

Canalizaciones flexibles

Crea canalizaciones personalizadas y aceleradas configurando más de 33 herramientas para cualquier necesidad específica de canalización o aplicación.

De 30 a 60 veces más rápido

De 30 a 60 veces más rápido

Reduce los costes informáticos hasta en un 50 por ciento ejecutándolas de 30 a 60 veces más rápido que las soluciones solo de CPU.

Aplicaciones aceleradas para el análisis genómico

Desde FASTQ hasta el Mapa de alineación binaria (BAM) y VCF, NVIDIA acelera el análisis genómico para flujos de trabajo somáticos, de línea germinal y variantes estructurales, además de mejorar las velocidades del secuenciador y la precisión de las llamadas de base de lectura de consenso.

De FASTQ al Mapa de alineación binaria (BAM) y VCF

Secuenciación de próxima generación en las instalaciones locales o en la nube

La ejecución de NVIDIA Clara Parabricks requiere un mínimo de dos GPU. Las licencias locales son suscripciones anuales por GPU, que incluyen acceso completo a todas las canalizaciones de la suite de software NVIDIA Clara Parabricks.

NVIDIA DGX A100

Soluciones en instalaciones locales

Al ejecutarse en NVIDIA DGX™ A100, Clara Parabricks analiza hasta 25,000 genomas completos por año (una cobertura 30 veces superior) con Genomic Analysis Toolkit (GATK) de Broad Institute. El rendimiento escala linealmente más allá de un solo DGX A100.

En la nube

En la nube, el tiempo es dinero. Elige entre una gama de instancias de GPU capaces de analizar genomas en cuestión de minutos. Para facilitar la implementación en AWS, Clara Parabricks está disponible en una imagen de máquina de Amazon (AMI) para su uso inmediato.

AWS Marketplace: canalizaciones de NVIDIA Clara Parabricks

Cómo Clara Parabricks tiene impacto en el mundo real

DeepVariant con Clara Parabricks

Centro de genética Regeneron

Aprende cómo Regeneron está utilizando DeepVariant con Clara Parabricks para generar datos escalables y de alta calidad que se pueden reproducir en toda la comunidad genómica.

NVIDIA DGX A100 y Clara Parabricks

National Biobank of Thailand (NBT)

NBT ha reducido su procesamiento de datos de secuenciación del genoma completo en 4 meses y su tiempo de procesamiento de usuario individual, de más de 30 horas a tan solo 1-2 horas con NVIDIA DGX A100 y Clara Parabricks.

GPU NVIDIA V100 Tensor Core

Translational Genomics Research Institute (TGen)

Con las GPU NVIDIA Clara Parabricks y NVIDIA V100 Tensor Core, TGen aceleró el análisis de secuenciación genómica por 6 para ayudar a determinar tratamientos personalizados para niños con trastornos neurológicos raros.

NVIDIA Clara Parabricks

Universidad Washington en Saint Louis (WUSTL)

La integración de pasos basados en GPU con NVIDIA Clara Parabricks permitió a Tychele Turner de WUSTL reducir drásticamente el tiempo de ejecución para las llamadas variantes de novo.

Recursos

  • Soporte para empresas
  • Documentación

Los servicios de soporte de canalizaciones de Parabricks te proporcionan una manera sencilla y fiable de mejorar la productividad y reducir el tiempo de inactividad de tus sistemas de producción. Los servicios de soporte de NVIDIA para Parabricks incluyen:

  • Comunicación directa con los expertos técnicos y de dominio de NVIDIA
  • Ayuda con la instalación y el uso de las canalizaciones de Parabricks
  • Respuesta rápida y resolución oportuna de problemas (se aceptan casos para soporte remoto 24/7)
  • Acceso a todas las actualizaciones de software, versiones de mantenimiento, correcciones de errores y parches de seguridad
  • Ayuda con soluciones temporales para errores confirmados

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Contacto parabricks-support@nvidia.com

Indicaciones generales

Clara Parabricks se puede configurar en solo 10 minutos con una prueba gratuita de 90 días. Mira un breve vídeo para obtener un tutorial paso a paso u obtén más información sobre el conjunto de software y las herramientas disponibles en la documentación técnica de Parabricks.

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