"Uno de los efectos más importantes e inmediatos de pasar del análisis unicelular al espacial es que se generan cantidades ingentes de datos", explica Banovich. Para contextualizar la magnitud del aumento de los datos espaciales, el equipo de Banovich realizó la secuenciación unicelular de ARN en el pulmón durante aproximadamente siete años y tomó muestras de más de 200 personas. Como resultado, generaron datos de aproximadamente 2,5 millones de células en total. En un contexto aún más amplio, la totalidad del proyecto Atlas de células pulmonares humanas es de 4 millones de células. TGen utiliza las principales plataformas espaciales, como Vizgen MERSCOPE y 10x Genomics Xenium Analyzer. Con estos instrumentos espaciales,
TGen captura entre 30 000 y 50 000 células por muestra, y una sola ejecución puede generar datos de más de 2 millones de células. "En dos ejecuciones en la plataforma Xenium, básicamente generamos datos de más células que la totalidad del proyecto Atlas de células pulmonares humanas, que supuso una labor de 40 investigadores y 10 países", explica Banovich. "Son cantidades de datos verdaderamente inmensas".
"Hemos creado el analizador Xenium Analyzer para ayudar a investigadores de vanguardia como TGen a pasar rápidamente del instrumento al conocimiento con nuestro potente análisis integrado, habilitado por las GPU de NVIDIA. La combinación de Xenium con NVIDIA RAPIDS acelera aún más nuestros mejores flujos de trabajo y permite realizar análisis más precisos para que los investigadores puedan pasar de la ejecución al resultado y del dato al descubrimiento aún más rápido. La labor de TGen sobrepasa los límites de la ciencia y transforma nuestra comprensión de la salud y la enfermedad. El mundo no puede permitirse esperar a estos descubrimientos", explica Adrian Benjamin, responsable global de marketing espacial en 10x Genomics.