基因體分析的加速運算
生物資訊學工作流程適用的解決方案，快速、精準且可擴充
NVIDIA Parabricks
加速基因體分析
NVIDIA® Parabricks® 是可擴充的基因體二級分析軟體套件，提供 GPU 加速版本的可靠開放原始碼工具。
Parabricks 與各大定序儀器相容，可供研究人員、生物資訊科學家與資料科學家在各種生物資訊學工作流程使用。
Parabricks 透過加速執行階段提升速度、降低成本，並且兼顧準確度與透明度。因此，研究人員可以更快發現生物學洞見並取得新發現。
NVIDIA AI Blueprints
輕鬆部署基因體與單細胞解決方案
NVIDIA AI Blueprints 是可輕鬆部署的輕量基因體和單細胞分析藍圖。
AI Blueprints 專為生物資訊學家與基因體平台供應商打造，使用者無需 GPU 或雲端資源，即可輕鬆部署及測試 NVIDIA Parabricks 和 NVIDIA RAPIDS™，包括由 scverse 開發的 RAPIDS-single-cell。
科學家與研究人員透過輕鬆評估和擴充加速基因體函式庫的可及性，能夠加速啟動及執行，促進對基因體的理解。
NVIDIA NIM 微服務
最佳化比對與變異偵測
NVIDIA NIM™ 微服務是正式環境就緒且最佳化的組合式微服務，內建比對用的 FQ2BAM，以及通用變異偵測用的 DeepVariant。
資料科學家和開發人員利用業界標準 API 便可取用生成式 AI 的最新技術進展，輕鬆建立及部署雲端原生應用程式。
縮短耗時的分析過程。無需耗費數小時，短短幾分鍾即可完成正式環境就緒且符合業界標準的比對。此外，還可將不同定序平台的變異偵測效能最佳化。
其他技術
開始使用
平台最新消息
獲得基因體最新版本、錯誤修復與重大安全更新等消息的通知。
聯絡我們
有任何疑問嗎？我們的醫療照護專家隨時為您提供協助！
常見問題
NVIDIA Parabricks 是二級基因體分析用的 GPU 加速軟體套件。Parabricks 與所有主流定序儀器相容，並支援多種不同的生物資訊學工作流程。
Parabricks 可提升二次基因體分析的速度、降低成本，並大幅提高準確度。
- 提高速度：相較於純 CPU 解決方案，全基因體定序 (WGS) 的分析速度快 135 倍。
- 降低成本：相較於純 CPU 解決方案，WGS 的運算成本最高降低 50%。
- 提高準確度：為所有主流定序儀部署高準確度的深度學習。
- 確保透明度：重現可信賴開源工具的執行結果。
Parabricks 在 NVIDIA NGC™ 以公開容器的形式提供，可用於內部部署環境或任何雲端服務平台或供應商。
NVIDIA 提供的 NVIDIA AI Enterprise，適用於臨床工作流程、大型定序專案、高傳輸量平台或其他需要立即協助之工作流程中需要 Parabricks 支援的客戶。
Parabricks 可在公有雲供應商、平台、合作夥伴，以及內部部署環境執行。
- 公有雲供應商：AWS、Google Cloud、Oracle Cloud、Microsoft Azure、Naver Cloud Platform、Baidu AI Cloud 與 Alibaba Cloud
- 平台與合作夥伴：DNAnexus、Seqera、AWS HealthOmics、Terra、Velsera、FormBio 與 Lifebit
- 內部部署：NVIDIA DGX™ 系統、NVIDIA 認證伺服器、Dell Technologies、Hewlett Packard Enterprise、Lenovo、Cisco、Atos 與 Supermicro
Parabricks 的準確度媲美開源工具，因此用 Parabricks 取代開源工具可獲得相同的結果。然而，Parabricks 還可加速這些工具，因此執行分析的速度更快。最新速度基準測試請參閱下表。
| NVIDIA RTX PROTM 6000 Newest Support | NVIDIA H100 SXM GPU | NVIDIA L4 GPU Lowest Cost Per Sample | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 2 GPUs | 4 GPUs | 2 GPUs | 4 GPUs | 2 GPUs | 4 GPUs | |
| Giraffe(Paired-End) | 59.37 | 31.05 | 60.10 | 37.68 | 81.43 | 44.57 |
| DeepSomatic | 43.28 | 23.93 | 54.32 | 35.13 | 215.33 | 110.05 |
| Fq2bam(BWA-MEM) | 9.02 | 6.52 | 10.10 | 7.28 | 35.10 | 19.28 |
| rna_fq2bam(STAR) | 7.55 | 7.03 | 7.78 | 10.23 | 22.28 | 12.73 |
| fq2bam_meth(BWA-Meth) | 32.27 | 22.13 | 34.60 | 20.35 | 132.43 | 67.03 |
| DeepVariant | 4.67 | 2.75 | 7.60 | 5.90 | 13.83 | 8.03 |
| HaplotypeCaller | 8.33 | 3.83 | 8.63 | 4.17 | 14.20 | 7.03 |
| Mutect2 | 29.50 | 13.52 | 27.67 | 13.67 | 50.91 | 26.63 |
最熱門 NVIDIA GPU 的最新基準測試，涵蓋最新支援、最快速度與最低單一樣本成本。
以分鐘為單位列出的效能時間。
Parabricks 以 Docker 影像形式提供，可在內部部署環境或任何搭載 NVIDIA GPU 的雲端環境執行。Parabricks 產生的結果與常見開源工具相當，因此可作為直接替換方案，加速現有工作流程的關鍵環節。此外，它完全可供配置，讓使用者能選擇要執行的步驟與參數設定，而且與各大工作流程管理器相容，例如 NextFlow 與 Cromwell。