端對端人工智慧藥物研發流程
BioNeMo 是一項人工智慧藥物研發雲端服務,以 NVIDIA NeMo Megatron 為基礎打造,可以超級運算規模訓練和部署大型生物分子 Transformer 人工智慧模型。這項服務包括預先訓練的大規模語言模型 (LLM),蛋白質、DNA、RNA 和化學的常見檔案格式原生支援,並適用於分子結構的 SMILES,還有適用於胺基酸和核苷酸序列的 FASTA 提供資料載入器。BioNeMo 框架也可供下載,以便在您自己的基礎架構上執行。
NeMo LLM
BioNeMo 配備三個預先訓練的大型語言模型。MegaMolBART 是使用 14 億個分子 (SMILES 字串) 訓練的生成化學模型,可用於各種化學資訊學應用程式。
ProtT5 和 ESM1-85M 是以 Transformer 為基礎的蛋白質語言模型,可用於產生學習內嵌,用於蛋白質結構和屬性預測等工作。
BioNeMo 讓開發人員能夠部署具有數十億至數兆個參數的大型語言模型。現今的蛋白質語言模型包含數十億個參數,需要使用超級運算基礎架構為廣大的化學空間進行推論。雲端中的動態資源擴充讓大型語言模型推論流程能夠自動擴充以滿足運算需求。
BioNeMo 讓您輕鬆開始使用支援 UniRef50 和 ZINC 資料庫的預先訓練模型、自動下載器和預先處理器。多虧有非監督式結構化學習工具,各種模型、嵌入和輸出可以組合在一起,集合多型態資料。非監督式預先訓練也能消除對標記資料的需求,快速產生學習內嵌以預測蛋白質結構、功能、細胞位置、水溶性、膜結合、保留和變異區域等。
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