端對端基因體定序分析
從 DNA 到 RNA，NVIDIA Clara™ Parabricks 大幅加速基因資料的一級、二級和三級分析。採用專為本機或雲端上高傳輸量實驗室所設計的一站式軟體，以及讓開發人員能夠打造強大基因體運算工具的技術堆疊，締造出強力加速佳績。
NVIDIA Clara Parabricks 流程是一款可立即執行的 GPU 加速的軟體套件，以 Broad Institute 的基因體分析工具組 (GATK) 為基礎，適用於：
群體基因體的 DNA 生殖細胞 變異偵測 癌症基因體與腫瘤突變負荷 (TMB) 的 DNA 體細胞 變異偵測 從轉錄體到單細胞分析的 RNA 定序專案 Google 的 DeepVariant。 能夠使用深度神經網路進行變異偵測
Clara Parabricks 流程已針對速度、準確度和可擴充性進行最佳化，可執行 GATK 4.1 最佳做法，並提供完整的設定彈性，讓使用者自行選擇要執行的步驟、參數設定和流程版本。
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以 NVIDIA A100 Tensor 核心 GPU 執行 Clara Parabricks 流程，可提供前所未有的效能，將 DNA 生殖細胞變異偵測的分析時間縮短至 23 分鐘。與僅使用 CPU 的解決方案相比，GPU 加速還能讓使用者減少多達 50% 的雲端運算成本。
生殖細胞端對端二級分析
此處的資料是使用公開資料產生的。這些公開資料讓 NA12878 取代了高達 30 倍覆蓋率的資料。在 23 分鐘的執行時間中，所使用的是具有 320G 記憶體的 DGX A100。原生 GATK4.1 的數據是利用 128 Gb RAM 並透過 32 vCPU [3.1 GHz Intel Xeon® Platinum 8175M] 產生的。
Clara Parabricks 流程可在 10 分鐘內設定完成。觀看這部逐步教學影片，準備體驗適用 DNA 和 RNA 定序專案的高傳輸量分析。
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與非 GPU 加速的解決方案相比，Clara Parabricks 流程能以更快的速度傳回結果。瞭解 TGEN 如何使用當日成果，研究健康/生病細胞的整個基因體定序，進而更精準地為每位患者判斷及量身打造最有效的療程。
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在雲端或本機中執行的 Clara Parabricks 流程能協助研究人員更快且更深入地瞭解如 COVID-19 病毒的全球大流行，包括病毒演變、人類反應，及人類感受性。觀賞並瞭解。
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這項服務可以讓您輕鬆穩定地提高生產力，並縮短生產環境分析系統的系統停機時間。Parabricks 的 NVIDIA 支援服務包括：
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NVIDIA Clara Parabricks 工具組是一系列 GPU 加速的邊緣函式庫、參考應用程式和開放原始碼應用程式，專為開發人員所打造，可用於基因體分析的人工智慧輔助工作流程。開發人員可透過此工具組，將從頭組裝的基因體的製圖、調校和改良作業最佳化，並提升單細胞表觀遺傳學的解析度。
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