NVIDIA Clara Parabricks

端對端基因體定序分析

從 DNA 到 RNA,NVIDIA Clara™ Parabricks 大幅加速基因資料的一級、二級和三級分析。採用專為本機或雲端上高傳輸量實驗室所設計的一站式軟體,以及讓開發人員能夠打造強大基因體運算工具的技術堆疊,締造出強力加速佳績。

加速基因體分析

  • 高傳輸量實驗室
  • 開發人員
Clara Parabricks 流程

Clara Parabricks 流程

NVIDIA Clara Parabricks 流程是一款可立即執行的 GPU 加速的軟體套件,以 Broad Institute 的基因體分析工具組 (GATK) 為基礎,適用於:

群體基因體的 DNA 生殖細胞 變異偵測
癌症基因體與腫瘤突變負荷 (TMB) 的 DNA 體細胞 變異偵測
從轉錄體到單細胞分析的 RNA 定序專案
Google 的 DeepVariant。 能夠使用深度神經網路進行變異偵測

Clara Parabricks 流程已針對速度、準確度和可擴充性進行最佳化,可執行 GATK 4.1 最佳做法,並提供完整的設定彈性,讓使用者自行選擇要執行的步驟、參數設定和流程版本。

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無可比擬的二級分析效能與傳輸量

 NVIDIA A100 Tensor 核心 GPU 執行 Clara Parabricks 流程,可提供前所未有的效能,將 DNA 生殖細胞變異偵測的分析時間縮短至 23 分鐘。與僅使用 CPU 的解決方案相比,GPU 加速還能讓使用者減少多達 50% 的雲端運算成本。

效能比較

生殖細胞端對端二級分析

為什麼使用 Clara Parabricks 流程

輕鬆上手

Clara Parabricks 流程可在 10 分鐘內設定完成。觀看這部逐步教學影片,準備體驗適用 DNA 和 RNA 定序專案的高傳輸量分析。

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加快診斷速度。更出色的治療成果。

與非 GPU 加速的解決方案相比,Clara Parabricks 流程能以更快的速度傳回結果。瞭解 TGEN 如何使用當日成果,研究健康/生病細胞的整個基因體定序,進而更精準地為每位患者判斷及量身打造最有效的療程。

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更好的基因體洞見

在雲端或本機中執行的 Clara Parabricks 流程能協助研究人員更快且更深入地瞭解如 COVID-19 病毒的全球大流行,包括病毒演變、人類反應,及人類感受性。觀賞並瞭解。

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Clara Parabricks 流程採用者

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population-genome-program
thailand-population-genome-program
personalis
tgen
institute-of-medical-science-university-of-tokyo
national-taiwan-university-hospital

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Clara Parabricks 支援

這項服務可以讓您輕鬆穩定地提高生產力,並縮短生產環境分析系統的系統停機時間。Parabricks 的 NVIDIA 支援服務包括:

  • 直接與 NVIDIA 技術專家和各領域專家交流
  • 協助部署和使用 Parabricks 流程
  • 快速回應且能及時解決問題 (24 小時全年無休的遠端支援)
  • 可獲得所有軟體升級、維護版本、錯誤修正與安全性修補程式
  • 為確認存在的錯誤提供臨時因應措施

立即開始使用

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請聯絡 parabricks-support@nvidia.com

Clara Parabricks 工具組

Clara Parabricks 工具組

NVIDIA Clara Parabricks 工具組是一系列 GPU 加速的邊緣函式庫、參考應用程式和開放原始碼應用程式,專為開發人員所打造,可用於基因體分析的人工智慧輔助工作流程。開發人員可透過此工具組,將從頭組裝的基因體的製圖、調校和改良作業最佳化,並提升單細胞表觀遺傳學的解析度。

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