透過 GPU 加速的分析,體驗高輸出量、高精準度的 DNA 和 RNA 定序。
NVIDIA Clara™ Parabricks® 是唯一以 GPU 加速的運算基因體工具組,能為定序中心、臨床團隊、基因體研究者以及新一代定序儀器開發人員提供快速、準確的基因體分析。
使用一流的工具加速應用程式
使用加速工具快速進行黃金標準生殖細胞、體細胞和 RNA 分析。
效能提高 80 倍
體驗比僅使用 CPU 的解決方案快 80 倍的加速,讓運算成本降低達 50%。
提高定序分析的準確度
透過 Clara Parabricks 和 GPU 將深度學習的強大功能帶入基因體分析。
善用靈活的工作流程
在工作流程描述語言 (WDL) 和 NextFlow 中設定工具,建立自訂工作流程。
Clara Parabricks 提供運算生物學家和生物資訊學家每天可使用的 GPU 加速版本工具,此可大幅加速執行時間、工作流程的可擴充性,並降低運算成本。
這包含與工作流程語言和管理員(WDL、NextFlow、Cromwell)完全相容,可輕鬆交匯由 GPU 和 CPU 驅動的工作,並能支援簡易的雲端部署 (AWS、GCP、Terra 和 DNAnexus)。
Clara Parabricks 可加速從 FastQ 到 Variant Call Format (VCF) 等一系列由 NVIDIA A100 Tensor 核心 GPU 硬體配置支援的執行階段。基因體研究人員在執行對照、排序、變異偵測等各個分析工作流程步驟時將可親身體驗加速效能。若使用更多 GPU,將可觀察到其運算時間與只使用 CPU 的系統相比,有近乎線性的成長,速度可提高達 80 倍以上。
30 分鐘內就能分析多達 30 倍以上的完整人類基因體
我們使用 NVIDIA DGX™ A100 320GB 系統進行 NVIDIA 執行階段。所有分析都是以 HG002 瓶中基因體 (GIAB NIST) 執行,定序範圍提升 30 倍,並使用 GATKv4.1.0 HaplotypeCaller 完成變異偵測。
Clara Parabricks 在單一 NVIDIA DGX™ A100 上執行,每年可使用基因體分析工具組 (GATK) 最佳實務分析多達 25,000 個完整基因體 (30 倍覆蓋率),輸送量線性地超越單一 DGX A100。
在雲端中,時間就是金錢。只需幾分鐘時間,就能從眾多 GPU 執行個體內選出能夠分析基因體的工具。為完成輕鬆部署,數間雲端供應商均有代管 Clara Parabricks 的影像且可立即使用。
我們與基因體儀器製造商合作,打造出可支援人工智慧、軟體定義的 DNA 定序器、空間轉錄體和其他體學裝置,進而提升準確度,以及可在邊緣端進行即時分析。
透過 Clara Parabricks 上的免費實作實驗室加速基因體分析,立即取得 NVIDIA 企業解決方案。
NVIDIA 與 Broad 合作,將 GPU 加速的 Parabricks 引進 Terra 平台,並優化人工智慧加速工作流程和大型語言模型以推動探查。
NBT 使用 NVIDIA DGX A100 與 Clara Parabricks,將完整基因體定序資料處理所需耗費的時間縮短 4 個月,且個別使用者處理時間從 30 小時減少至 1 至 2 小時。
東京大學的 HGC 宣佈利用 NVIDIA Clara Parabricks 管道基因體應用軟體推出全新基因體平台,可將基因體分析速度提升 40 倍,此比 CPU 環境快 40 倍。
Regeneron 正使用搭載 Clara Parabricks 的 DeepVariant,產生能夠在整個基因體社群中重現的可擴充、高品質資料。
Ultima Genomics 正與 NVIDIA 合作,透過人工智慧和加速運算提供價值 100 美元的基因體定序。
Singular Genomics 與 NVIDIA 合作,提供領先業界的新一代定序和分析速度。
Oxford Nanopore 正在升級其 PromethION 運算塔,從 NVIDIA V100 到 A100 技術。這種處理能力的提升將使其跟上高精準度基礎,並能大幅擴展超精確演算法的容量。
一組研究人員在 5 小時 2 分鐘內創下新的 DNA 定序記錄,臨床醫師可以從重症照護患者身上抽血,並在當日達成基因疾病診斷。
史丹佛大學將 DeepVariant 的 GPU 加速的實作與 NVIDIA Clara Parabricks 整合,證明可大幅縮短執行時間。
Purdue 的研究人員完成一項研究,用於評估病原體基因變異辨識 GPU 加速的運算框架的效能和準確度。
立即免費使用 NVIDIA Clara Parabricks。
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