Clara 是一套用於生物醫學研究的開源 AI 基礎模型、工具與範本集合。 Clara 包含適用於基因體學、蛋白質和分子結構、影像、3D 解剖學、手術機器人技術,以及符合物理定律模擬的數位孿生 AI 基礎模型。 這些模型採用各大開放式臨床、影像與生物資料集打造。
Clara 直接與 NVIDIA 的 AI 軟體堆疊整合。 這個架構一應俱全,包含預先訓練的檢查點、新穎的模型架構、訓練方案、精選的開放式資料集與工具,以及統一的基準測試和評估框架。
BioNeMo 框架是一款開放式機器學習框架,用於建構及訓練生物製藥深度學習模型。
透過加速 AI 模型開發最昂貴且耗時的過程,使用 DNA、RNA 與蛋白質資料進行生物分子研究的 AI 模型製造商可存取工具,將研究規模提升至全新境界。
該平台包含精心策劃的訓練方法、資料載入工具,以及預先訓練的最佳化範例 AI 模型架構,這些架構針對特定領域,並經過加速以實現最佳效能,讓 AI 模型的建構更快、更簡單。
NVIDIA BioNeMo Blueprints 是預先訓練的參考工作流程,專為藥物研發領域的生成式 AI 應用程式而設計,為生物製藥團隊提供加速研究與創新的基礎。
對於希望整合 AI 的生物製藥組織,這些藍圖包含參考程式碼、工具與完整文件,可針對專有資料與獨特的治療流程,客製化並部署工作流程。
這些生成的資料飛輪可隨著時間推移提升模型效能,推動更深入的見解並加速研發。BioNeMo Blueprints 讓生物製藥簡化創新流程,並釋放 AI 在藥物研發領域的潛力。
NVIDIA BioNeMo NIM™ 包含一套經過最佳化、易於使用的 AI 微服務,旨在實現千兆級推論,並在藥物設計領域實現全新功能。
NIM 微服務專為運算藥物研發平台開發人員與資料科學家打造,以容器形式構建,內含所有必要組件,提供最高效、可攜式的部署方式,方便透過 API 輕鬆整合至企業級 AI 應用。
NIM 微服務可提升藥物研發工作流程的效率與創新能力,同時降低 AI 驅動探索的總體擁有成本與上市時間。
NVIDIA CUDA-X™ 函式庫提供直接附帶的程式碼模組,可加速現今生物分子 AI 模型中運算密集度最高的層,讓研究人員更快速地創新。
cuEquivariance 是一個 NVIDIA 的 Python 函式庫,旨在透過分段張量積 (segmented tensor products) 協助建構高效能等變神經網路。cuEquivariance 現在也針對三角形注意力和三角形乘法,為蛋白質結構預測中的成對互動建模提供最佳化核心 (例如 AlphaFold 風格的架構)。
透過 PyTorch 和 Jax 綁定,只需變更單行程式碼並使用開箱即用的整合功能,就能輕鬆利用 CUDA® 最佳化核心替換工作流程中最昂貴的步驟。
瞭解 cuEquivariance 如何在您的蛋白質結構、生成化學和分子動力學模型中解鎖全新的效能水準。
請前往 NVIDIA BioNeMo 文件中心尋找文件、指南、手冊與操作說明等資源。
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NVIDIA BioNeMo 是一個專為化學與生物領域打造的 AI 平台,旨在擴大 AI 的開發與部署規模。 這個平台讓藥物研發研究與開發人員以更快速簡單的方式,從標靶識別到先導化合物最佳化的藥物研發流程,建構並整合最先進的生成式 AI 應用。該平台提供 3D 蛋白質結構預測、從頭設計、虛擬篩選、對接與特性預測的工作流程。
BioNeMo 是一個不斷發展的數位生物學平台,提供存取最新加速函式庫與基礎模型以支援生成式 AI。研究人員和開發人員可輕鬆採用及調整開源 BioNeMo 框架的函式庫和模型,並利用 BioNeMo NIM 微服務和藍圖快速部署加速工作流程。
NVIDIA BioNeMo 框架:使用者可透過兩種方式取用 BioNeMo 框架。 NVIDIA 提供隨附 NVIDIA AI Enterprise 授權的企業級 BioNeMo 使用服務,透過 NVIDIA GPU Cloud 提供 BioNeMo 容器,帶來安全可擴充的工具鏈供企業開發人員和研究人員建立生物分子工作流程。從 GitHub 安裝研究人員與資料科學家使用的開源版 BioNeMo,其中包含所有元件。
預先訓練的模型:BioNeMo 框架提供 BioNeMo 範例程式,展示 Transformer Engine 相容架構的實作範例,並支援輕鬆測試與微調。 鼓勵使用者以 BioNeMo 範例程式為教學課程,擴展自己的實作方式。
BioNeMo NIM 微服務提供各種最佳化檢查點,例如 Evo2 (基因體生成式 AI)、GenMol (分子生成) 和 DiffDock (對接) 等,每個檢查點皆支援各自的生物分子任務。
請造訪 NGC Catalog Container 頁面,查看 BioNeMo Framework 的最新系統需求清單。
請造訪 NVIDIA API Documentation,查看 NIM 微服務的最新系統需求。
BioNeMo 框架程式碼採用 Apache 2.0 授權,而官方 NGC 容器則受 NVIDIA AI 產品協議約束 (商業用途可透過 NVIDIA AI Enterprise 授權涵蓋)。
NVIDIA BioNeMo 透過函式庫、API 和容器化 NIM 微服務公開模型,讓團隊直接從既定的藥物研發流程調用結構預測、生成式化學和其他函數。
發佈 BioNeMo 框架容器或複製 GitHub 儲存庫、將 YAML 配置指向您的資料、新增 restore_from_path (或等效設定) 以載入現有權重,並執行提供的訓練指令碼以預訓練或微調模型。
由於 BioNeMo Framework 是 GitHub 公開託管的,開發人員可分叉儲存庫,並依照儲存庫說明文件中的 「CONTRIBUTING」指引提交拉取要求,以新增程式碼。
如果您有問題,歡迎與我們聯絡。
此外,使用者還能透過 BioNeMo 資源中心存取說明文件、教學課程和活躍的開發人員論壇,而企業客戶則能透過 NVIDIA AI Enterprise 開立支援票證。