Ricerca genomica accelerata per la medicina di precisione

L'uso dei dati di sequenze del DNA per la diagnosi e la ricerca scientifica promette cambiamenti rivoluzionari nella medicina moderna, tuttavia il tempo per l'analisi può rappresentare un ostacolo non da poco. In media, un intero genoma umano genera 100 GB di dati di sequenze compressi, che devono essere elaborati utilizzando quasi mille ore di CPU per generare conclusioni di rilevanza biologica per i genetisti, i biologi e i fisici.

Analisi più veloci risulterebbero in scoperte più veloci, riducendo i costi e inserendo l'analisi genomica nelle pratiche sanitarie standard. Questo white paper di Parabricks esamina la natura di elaborazione intensiva dell'analisi genomica, delinea il flusso di lavoro accelerato per allineamento, pre-elaborazione e ricerca delle varianti, e dimostra come le GPU possono accelerare le attività di sequenziamento parallelizzabili nell'elaborazione genomica in diverse fasi per ridurre i tempi totali di analisi e soddisfare i requisiti temporali dell'elaborazione delle sequenze genomiche.

Accelerated Genomics Discoveries for Precision Medicine

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