Basée sur le GATK (kit d’outils pour l’analyse génomique) du Broad Institute de Cambridge, NVIDIA Clara Parabricks Pipelines est une suite logicielle entièrement accélérée par GPU. Elle est prête à l’utilisation dans le cadre de l’analyse des appels de variante d’ADN à lignée germinale pour la génomique des populations, l’analyse des appels de variante d’ADN somatique pour la génomique du cancer et les projets de séquençage ARN pour l’analyse unicellulaire relative au transcriptome total.
Spécialement optimisée pour la vitesse, la précision et l’évolutivité, la suite logicielle Clara Parabricks Pipelines permet de mettre en œuvre les meilleures pratiques d’utilisation avec la version 4.1 de GATK. Elle est entièrement configurable, ce qui permet aux utilisateurs de choisir eux-mêmes les différentes étapes, paramètres et versions du pipeline à exécuter.
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