Accélération des découvertes génomiques pour la médecine de précision

L’utilisation du séquençage ADN pour le diagnostic et la recherche pharmaceutique va constituer un changement révolutionnaire de la médecine moderne, mais la durée des procédures d’analyse traditionnelles représente encore un obstacle majeur. En moyenne, un génome humain entier génère jusqu’à 100 Go de données compressées. Leur traitement par CPU peut requérir près d’un millier d’heures afin de générer des conclusions significatives pour les généticiens, les bio-informaticiens et les médecins.

L’accélération des procédures d’analyse permet de faire des découvertes plus rapidement, mais aussi de réduire les coûts de la recherche en intégrant l’analyse génomique au cœur des pratiques médicales. Ce dossier de Parabricks analyse la nature intensive de l’analyse génomique et détaille comment les workflows accélérés par GPU permettent d’améliorer l’alignement, le prétraitement et l’appel de variantes. Découvrez par ailleurs comment les GPU NVIDIA peuvent accélérer de plusieurs façons la parallélisation des tâches de séquençage pour le traitement génomique, de manière à optimiser la durée d’analyse totale et à réduire les délais de traitement pour le séquençage de génomes.

Accelerated Genomics Discoveries for Precision Medicine

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