NVIDIA Clara Parabricks で、ハイスループットで高精度な DNA や RNA シーケンシングを体験してください。
NVIDIA Clara™ Parabricks で、より速く、より正確なゲノム解析を実現しましょう。GPU を活用したゲノミクス計算アプリケーション フレームワークである Clara Parabricks は、研究者、臨床チーム、医療センター、遺伝子病や癌の研究をしているシーケンシング センターに、次世代のシーケンシング データの正確で高速な解析を提供します。
ハイ スループット
1 台のサーバーで 1 日あたり最大 60 本の全ゲノムを処理します。
精度の向上
ターンアラウンドタイムを短縮するために精度を犠牲にする必要がありません。一組の生殖系列と体細胞コーラーが利用できます。
柔軟なパイプライン
特定のパイプラインまたはアプリケーションのニーズに合わせて 33 を超えるツールを構成することで、カスタマイズした高速化のパイプラインを作成します。
30–60 倍の速さ
CPU のみのソリューションと比較して 30-60 倍の速さで実行することで、コンピューティング コストを最大 50% 削減します。
FASTQ から Binary Alignment Map (BAM) に VCF まで、NVIDIA は体細胞、生殖細胞、構造変異のワークフローのゲノム解析を高速化し、シーケンサーの速度とコンセンサス読み取りベースの コーリング精度を向上します。
NVIDIA Clara Parabricks を実行するには、少なくとも 2 つの GPU が必要です。オンプレミス ライセンスは GPU ベースの年間サブスクリプションで、NVIDIA Clara Parabricks ソフトウェア スイートのすべてのパイプラインに完全アクセスできます。
1 台の NVIDIA DGX™ A100 で実行される Clara Parabricks では、Broad Institute の Genomic Analysis Toolkit (GATK) を利用し、年間最大 25,000 本の全ゲノムを解析しています (30 倍のカバー率)。スループットは 1 台の DGX A100 を超えて直線的に拡大します。
クラウドでは、「時は金なり」です。ほんの数分でゲノムを解析できる GPU インスタンスをご用意しています。AWS では簡単にデプロイできるよう、Amazon Machine Image (AMI) には Clara Parabricks があり、すぐに利用できます。
Regeneron は DeepVariant と Clara Parabricks を利用し、ゲノミクス コミュニティ全体で再生産できるスケーラブルな高品質データを生成しています。
NBT は NVIDIA DGX A100 と Clara Parabricks を利用し、全ゲノム シーケンシング データ処理を 4 か月短縮し、個別ユーザー処理を 30 時間超からわずか 1 ～ 2 時間に短縮しました。
NVIDIA Clara Parabricks と NVIDIA V100 Tensor コア GPU を利用し、TGen はゲノミクス シーケンシング解析を 6 倍高速化し、希少な神経疾患を持つ子供たちに、一人ひとりに合わせた治療を提供しています。
GPU ベースの手順と NVIDIA Clara Parabricks を統合することで、WUSTL の Tychele Turner 助教授は de novo 変異コーリングの実行時間を劇的に短縮できました。
Parabricks パイプライン サポート サービスは、生産分析システムの生産性を向上し、システム ダウンタイムを減らす、簡単で信頼性の高い方法を提供します。NVIDIA の Parabricks のサポート サービスの内容:
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parabricks-support@nvidia.com までお問い合わせください。
Clara Parabricks の 90 日間無料トライアルはわずか 10 分でセットアップできます。チュートリアルの短い動画をご視聴ください。利用できるソフトウェア スイートとツールについては、Parabricks テクニカル ドキュメントでご確認いただけます。
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