Durchgehende Genomsequenzanalyse
Schnellere und genauere Genomanalysen mit NVIDIA Clara™ Parabricks. Clara Parabricks, ein GPU-beschleunigtes Anwendungsframework für computergestützte Genomik, liefert genaue und beschleunigte Analysen von Sequenzierungsdaten der nächsten Generation für Forscher und klinische Teams sowie medizinische und Sequenzierungszentren für genetische Krankheiten und Krebs.
Hoher Durchsatz
Verarbeiten Sie bis zu 60 kopmlette Genome pro Tag auf einem einzigen Server.
Erhöhte Genauigkeit
Sie müssen nicht auf Genauigkeit verzichten, um die Durchlaufzeit zu verkürzen. Eine Reihe von Keimbahn- und somatischen Detektoren ist verfügbar.
Flexible Pipelines
Erstellen Sie benutzerdefinierte, beschleunigte Pipelines, indem Sie über 33 Tools für jede spezifische Pipeline oder Anwendungsanforderung konfigurieren.
30- bis 60-mal schneller
Senken Sie die Rechenkosten um bis zu 50 Prozent, indem Sie 30- bis 60-mal schneller arbeiten als mit reinen CPU-Lösungen.
Von FASTQ über Binary Alignment Map (BAM) bis hin zu VCF beschleunigt NVIDIA die Genomanalyse für somatische, Keimbahn- und strukturelle Varianten-Workflows sowie die Verbesserung der Sequenzergeschwindigkeit und der Genauigkeit von Konsenslesebasisaufrufen.
Zum Ausführen von NVIDIA Clara Parabricks sind mindestens zwei GPUs erforderlich. Lokale Lizenzen sind Jahresabonnements auf GPU-Basis, die vollen Zugriff auf alle Pipelines in der NVIDIA Clara Parabricks-Software-Suite beinhalten.
Clara Parabricks läuft auf einer NVIDIA DGX™ A100 und analysiert mit dem Genomic Analysis Toolkit (GATK) des Broad Institute bis zu 25.000 komplette Genome pro Jahr (30-fache Abdeckung). Der Durchsatz skaliert linear über eine einzelne DGX A100 hinaus.
In der Cloud ist Zeit Geld. Wählen Sie aus einer Reihe von GPU-Instanzen, die Genome in wenigen Minuten analysieren können. Für eine einfache Bereitstellung auf AWS stehen Clara Parabricks in einem Amazon Machine Image (AMI) zur sofortigen Verwendung zur Verfügung.
Erfahren Sie, wie Regeneron DeepVariant mit Clara Parabricks verwendet, um skalierbare, qualitativ hochwertige Daten zu generieren, die in der gesamten Genomik-Community reproduziert werden können.
Die NBT reduzierte mit NVIDIA DGX A100 und Clara Parabricks die gesamte Genomsequenzdatenverarbeitung um vier Monate und die individuelle Nutzerverarbeitungszeit von über 30 Stunden auf nur 1 bis 2 Stunden.
Mit NVIDIA Clara Parabricks und NVIDIA V100 Tensor-Recheneinheiten-GPUs beschleunigte TGen die genomische Sequenzierungsanalyse um das 6-fache, um personalisierte Behandlungen für Kinder mit seltenen neurologischen Erkrankungen zu bestimmen.
Die Integration von GPU-basierten Schritten mit NVIDIA Clara Parabricks ermöglichte es Tychele Turner von WUSTL, die Laufzeit für De Novo-Variantenaufrufe drastisch zu reduzieren.
Parabricks Pipelines Support Services bietet Ihnen einen einfachen und zuverlässigen Weg, Ihre Produktivität zu steigern und die Ausfallzeiten von Produktionsanalysesystemen zu reduzieren. NVIDIA-Supportdienste für Parabricks umfassen:
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Kontaktieren Sie parabricks-support@nvidia.com
Clara Parabricks kann in nur 10 Minuten mit einer 90-tägigen kostenlosen Testversion eingerichtet werden. Sehen Sie sich ein kurzes Video für eine Schritt-für-Schritt-Anleitung an oder erfahren Sie mehr über die Software-Suite und die Tools, die in der technischen Dokumentation von Parabricks verfügbar sind.
NVIDIA Parabricks-Video – Erste Schritte >
Nvidia Parabricks – Technische Dokumentation >
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